硅藻土辅助的高效RNA提取技术及其小RNA富集应用
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更新于2024-09-06
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"一种广泛适用的RNA提取方法"
本文介绍了一种新型的RNA提取技术,旨在克服在处理多种动植物及微生物样本时常见的RNA提取难题。RNA的高质量提取是基因表达、调控研究和基因工程的基础,但RNase(核糖核酸酶)、多糖和多酚等物质会干扰这一过程。该方法利用硅藻土对RNase的吸附性,结合聚乙烯吡咯烷酮(PVP)、高盐浓度和乙二醇丁醚等试剂,设计了一种通用的RNA提取方案。
首先,硅藻土的使用能够有效地去除样本中的RNase,这是RNA降解的主要因素之一。接着,高盐浓度有助于破坏细胞结构,释放RNA,同时抑制RNase活性。PVP可以络合多酚,防止其与RNA形成不溶性复合物,从而保护RNA不受损害。最后,乙二醇丁醚的沉淀作用有助于纯化RNA,提高其得率和完整性。
该方法在多个具有挑战性的样本中得到了验证,包括富含多糖的玉米胚乳、含有大量RNase的动物肝脏、多酚和油脂丰富的银杏、麻疯树以及木霉和酵母等微生物。实验结果显示,提取的RNA质量良好,适用于RT-PCR等后续分子生物学实验。
此外,作者还通过添加LiCl、PEG8000和NaCl,进一步优化了RNA的沉淀步骤,成功去除了RNA中的大片段,富集了小RNA,如osa-mir-156这样的microRNA(miRNA)。这些小RNA可用于miRNA克隆和其他下游实验,展示了该方法在miRNA研究中的应用潜力。
这项工作提供了一种经济、高效且适应性广泛的RNA提取技术,尤其适用于那些传统方法难以处理的样本,对于基因表达调控和小RNA研究等领域具有重要的实践意义。
2021-07-26 上传
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