MATLAB实现图像聚类分析与面积计算

资源摘要信息:"matlab聚类分析代码计算面积-aggregates-picker:聚合选择器" 1. MATLAB软件环境配置 MATLAB R2019b是本资源中使用的软件版本，用户需要确保在运行自定义代码“ap.m”之前安装此版本，以保证代码能够正确执行。此外，用户需要在Windows 10版本1903或macOS High Sierra版本10.13.6操作系统上测试该代码。确保MATLAB软件的运行环境与资源描述中提到的操作系统版本一致，以避免可能的兼容性问题。 2. MATLAB图像处理工具箱 “图像处理工具箱”是操作自定义代码“ap.m”所必需的附加包。用户需要确保已经安装此工具箱，因为它包含进行图像处理所必须的函数和工具。在MATLAB中安装相应工具箱的具体步骤通常可以通过MATLAB的官方文档找到，或通过MATLAB自带的Add-On Explorer进行安装。 3. 自定义代码“ap.m” “ap.m”是一个自定义的MATLAB脚本，专门用于从16位TIF图像中自动选择和计算聚合/簇索引。为了使其正确运行，所有必要的文件（包括“ap.m”脚本和要分析的TIF图像）都应该存储在同一文件夹内。 4. TIF图像格式 TIF（Tagged Image File Format）图像文件是一种常用的位图图像格式，可以包含多于8位的深度信息。在此资源中，特别指明了使用16位TIF图像。在处理图像之前，用户需了解图像的深度信息，因为这可能会影响图像的处理方式和最终分析结果。 5. 聚合/簇的定义和选择 资源中提到的“聚合”和“簇”是指图像中的一些特定区域或像素集合，它们可能通过颜色、亮度或其他特征被区分出来。在图像分析中，通过选择背景和单元格区域，可以计算出这些聚合/簇的相关属性，如面积。用户在操作时将通过多次单击鼠标左键形成一个封闭区域，以此来选择背景，然后重复该过程选择单元格区域。 6. MATLAB命令窗口使用 用户在运行MATLAB后需要通过命令窗口来调用“ap.m”脚本。这涉及到输入脚本文件的名称“ap”，而后MATLAB将执行相应的操作。在本资源中，MATLAB显示了来自示例TIF文件的8位图像，这用于展示而非计算荧光强度。 7. 运行时间估计 资源中给出了一个大概的运行时间估计，即在普通计算机上运行该脚本的平均时间为3分钟。这个估计可能因计算机性能差异而有所变化，但是可以为用户执行前提供一个参考时间。 8. 开源系统标签 标签“系统开源”意味着“aggregates-picker:聚合选择器”的源代码是公开的，用户可以访问和修改源代码以适应自己的需求。开源系统通常允许更广泛的用户群体对代码进行审查、修改和再发布，从而促进了技术共享和创新。 9. 文件名称列表 资源中提到的压缩包子文件的名称列表是“aggregates-picker-main”。这个列表可能包含整个项目的文件，包括但不限于自定义脚本“ap.m”，图像文件，以及其他可能的辅助文件和文档。用户需要将此文件夹解压，以访问所有必要的文件来进行分析。 总结以上各点，本资源为用户提供了在MATLAB环境下的自定义聚类分析代码，用于自动选择和计算图像中聚合/簇的索引。用户需注意软件版本兼容性、图像格式、图像处理工具箱的安装以及脚本文件的正确使用方法。通过本资源，用户可以进行精确的图像分析工作，计算出聚合区域的面积等关键属性。