MATLAB实现多重比较p值调整工具-FakeNMC/pval_adjust
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更新于2024-11-30
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资源摘要信息:"fakenmc/pval_adjust:调整多重比较的 p 值-matlab开发"
知识点详细说明:
1. MATLAB/Octave 函数:该资源提供了一个用于调整多重比较 p 值的函数,适用于 MATLAB 和 Octave 两种计算环境。MATLAB(矩阵实验室)是一种用于数值计算、可视化以及编程的高级语言和交互式环境,广泛应用于工程计算、数据分析、算法开发等领域。Octave 是一个与 MATLAB 具有较高兼容性的免费软件包,它的语法和函数与 MATLAB 非常相似。
2. p值的多重比较调整:在统计学中,进行多个假设检验时,单个检验的显著性水平(例如α=0.05)可能会因为多重比较而增加整体的错误发现率。为了校正这种现象,需要对各个检验的 p 值进行调整。这个调整过程被称为多重比较校正,其目的是控制多重比较的总体第一类错误率。
3. 多重比较校正方法:该函数支持多种调整方法,包括:
- Holm:Holm 的步骤下界方法,是一种用于校正 p 值的逐次步骤方法。
- Hochberg:Hochberg 的上界方法,与 Holm 类似,但使用不同的步骤顺序。
- Hommel:Hommel 方法,一种更复杂的校正方法,适用于小样本和大样本。
- Bonferroni:Bonferroni 校正,通过将原始 p 值乘以比较次数进行校正。
- BH:Benjamini-Hochberg 程序,也称为 FDR(假发现率)控制方法,旨在降低发现率到指定的水平。
- BY:Benjamini-Yekutieli 方法,类似于 BH 方法,但更适合在不同假设检验间存在相关性时使用。
- fdr:假发现率(False Discovery Rate)控制方法,通常指 BH 方法。
- Sidak:Šidák 校正,一种更为保守的校正方法,基于概率的乘积。
- 无:不执行任何校正方法,保持原始的 p 值。
4. p.adjust R 函数:该资源是 R 语言中 p.adjust 函数的 MATLAB/Octave 版本实现。R 是一种用于统计分析、图形表示和报告的语言和环境。R 中的 p.adjust 函数也提供了多种 p 值调整方法,该资源提供了与 R 中类似功能的函数,但略有差异,例如不处理缺失值,并增加了 Šidák 校正方法。
5. Šidák校正方法:Šidák 校正是一种基于概率的校正方法,用于多重假设检验的 p 值调整。该方法假设检验是独立的,并通过调整每个比较的显著性水平来控制整体的错误发现率。该方法比 Bonferroni 方法相对宽松一些,尤其在独立性假设成立时效率更高。
6. 引用提示:该资源强调,如果在研究中使用了该脚本,则应引用相关的学术论文。这显示了科研领域的学术诚信,即对原创研究的尊重以及对贡献者工作的认可。
7. 文件压缩包子包:资源以 github_repo.zip 文件的形式提供,意味着用户需要解压缩文件以获取完整的函数代码及其相关文件。在使用之前,用户应确认压缩包中包含的内容,比如函数的 MATLAB 或 Octave 源代码文件,可能还包括使用示例、文档说明等。
在实际应用中,研究人员或数据分析师可以根据自己的研究设计和数据特点,选择合适的多重比较校正方法,使用该资源提供的函数对 p 值进行校正。这将有助于他们更准确地解释统计结果,并减少因多重比较而带来的误导性结论。
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2021-03-18 上传
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