LC/MS代谢组学数据标准化方法的比较研究
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更新于2024-09-05
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比较LC/MS代谢组学数据的各种标准化方法
代谢组学是一种系统生物学技术,旨在研究生物体内的代谢过程和代谢物的变化。然而,在代谢组学数据处理中,规范化是一个非常重要的步骤。规范化的目标是减少非生物来源的变异(例如仪器批次效应),同时保持生物变异。
在LC/MS代谢组学数据处理中,常见的规范化方法有多种,如通过总离子流(TIC)调整每个样本,即对于样品中的每个特征,将其强度值除以样品的总和。然而,这些方法的许多假设在代谢组学数据集中都是可疑的。
本文对各种标准化方法进行了比较,包括通过桥梁样品中的中位水平(BRDG)和实验样品(MED)的中值进行调整的方法。通过比较标准化值与大型人血浆数据集中一部分代谢物的靶向测定值的相关性来评估这些方法。结果表明,BRDG和MED归一化技术大大优于其他方法,后者通常比完全不归一化要差。
在LC/MS代谢组学数据处理中,规范化是一个非常重要的步骤。不同的规范化方法可以对数据处理结果产生很大的影响。因此,选择合适的规范化方法对于获取可靠的结果是非常重要的。
在本文中,我们对各种标准化方法进行了比较,包括通过总离子流(TIC)调整每个样本、通过桥梁样品中的中位水平(BRDG)和实验样品(MED)的中值进行调整的方法。结果表明,BRDG和MED归一化技术大大优于其他方法,后者通常比完全不归一化要差。
对于代谢组学数据的处理,规范化是一个非常重要的步骤。不同的规范化方法可以对数据处理结果产生很大的影响。因此,选择合适的规范化方法对于获取可靠的结果是非常重要的。
在LC/MS代谢组学数据处理中,规范化可以减少非生物来源的变异,保持生物变异。不同的规范化方法可以对数据处理结果产生很大的影响。因此,选择合适的规范化方法对于获取可靠的结果是非常重要的。
本文对各种标准化方法进行了比较,结果表明,BRDG和MED归一化技术大大优于其他方法,后者通常比完全不归一化要差。因此,在LC/MS代谢组学数据处理中,选择合适的规范化方法对于获取可靠的结果是非常重要的。
本文对各种标准化方法进行了比较,结果表明,BRDG和MED归一化技术大大优于其他方法,后者通常比完全不归一化要差。这项研究为LC/MS代谢组学数据处理提供了重要的参考价值。
知识点:
* 代谢组学是一种系统生物学技术,旨在研究生物体内的代谢过程和代谢物的变化。
* 规范化是一个非常重要的步骤在LC/MS代谢组学数据处理中。
* 不同的规范化方法可以对数据处理结果产生很大的影响。
* 选择合适的规范化方法对于获取可靠的结果是非常重要的。
* BRDG和MED归一化技术大大优于其他方法,后者通常比完全不归一化要差。
* 在LC/MS代谢组学数据处理中,规范化可以减少非生物来源的变异,保持生物变异。
2021-03-04 上传
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