SNaPshot技术平台:高通量SNP基因分型分析
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更新于2024-08-18
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"Snapshot技术平台中文.docx"
Snapshot技术平台是由Applied Biosystems (ABI) 公司开发的一种专门用于Single Nucleotide Polymorphism (SNP) 检测的分析软件和试剂盒。该技术结合了minisequencing的概念,能够同时对多个SNP位点进行基因分型。它的核心在于设计不同长度的引物,使得每个SNP位点的引物3'端紧邻突变点,确保在聚合酶的作用下仅延伸一个核苷酸。这种技术依赖于3730、3130等PCR测序仪,通过电泳分离、五色荧光检测以及Genemapper软件分析,实现对多个SNP位点的一次性检测。
3730XL型DNA序列检测仪是支持Snapshot技术的重要设备,它在SNP分析中扮演着关键角色。SNaPshot的工作原理基于双脱氧终止法,但只使用荧光标记的ddNTP。在PCR反应中,每条引物根据模板序列仅延伸一个核苷酸,并通过荧光检测系统确定延伸的核苷酸类型。对于多重SNaPshot反应,每个待测SNP位点对应一条特异性的引物,这些引物具有不同的长度,以5'端的PolyC或PolyT序列来区分。这样,通过电泳,不同SNP位点的产物可以被有效分离。理想的引物设计应使最短的引物为20bp,相邻SNP位点的引物长度差通常在4-6个核苷酸之间。
多重SNaPshot反应的高通量特性在于,一次反应可以处理4-5个SNP,大大提高了基因分型的效率。实验的进度和通量受到多重PCR和延伸条件的优化,以及3730XL等测序仪的处理能力影响。例如,3730XL每天能完成16次96孔电泳,若每次检测4个位点,那么每天最多可处理6000个基因分型。
Snapshot技术在遗传学研究、疾病风险评估、个性化医疗等领域有广泛应用。它不仅简化了SNP分析流程,提高了分析速度,还降低了成本,成为现代生物医学研究中不可或缺的工具之一。通过优化实验条件和提高自动化水平,Snapshot技术平台持续为科学研究和临床诊断提供高效、准确的解决方案。
2020-05-20 上传
2023-06-02 上传
2023-06-09 上传
2024-06-16 上传
2023-06-10 上传
2024-02-01 上传
FROM openjdk:17 ADD ./demo-0.0.1-SNAPSHOT.jar app.jar CMD java -jar demo-0.0.1-SNAPSHOT.jar那这里应该怎么暴露
2024-06-16 上传
2023-06-02 上传
2023-04-19 上传
2023-07-10 上传
feifei_2019
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