没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
首页金龟子绿僵菌MPI基因cDNA克隆与结构分析:保守序列与同源比较
本文档主要探讨了"金龟子绿僵菌甘露糖6-磷酸异构酶基因cDNA序列的克隆及分析"这一科研成果,发表于2011年8月的《广东海洋大学学报》第31卷第4期。研究者李亚利用RT-PCR和RACE-PCR技术,通过对绿僵菌属甘露糖6-磷酸异构酶基因保守核苷酸区域的设计,成功克隆了金龟子绿僵菌mpi基因的cDNA序列。这个cDNA序列全长达到了1513bp,其中开放阅读框(ORF)长度为1328bp,编码出了441个氨基酸。 在基因序列分析中,BLAST比对结果显示,该基因编码的氨基酸序列与其他真菌具有较高的同源性,这表明其可能在进化过程中保留了重要的功能特性。进一步的蛋白结构分析揭示,MPI蛋白具有较为保守的蛋白磷酸酶结构特征,主要由α螺旋和不规则卷曲构成,这种结构对于该蛋白的功能执行至关重要。 这项研究不仅提供了金龟子绿僵菌MPI基因的分子生物学信息,也为了解该菌种的生物学特性和潜在应用提供了基础。它可能涉及昆虫生物防治领域,如用于开发新型的生物农药或者生物控制策略。此外,研究还得到了广东省自然科学基金和湛江市科技计划项目的资助,显示了学术界对此类基础研究的重视。 通过这篇论文,读者可以了解到基因克隆技术在微生物学领域的具体实践,以及基因序列分析如何帮助我们理解不同物种间蛋白质结构的相似性和差异,这对于生物技术、农业生物防治以及分子生态学等领域都具有重要意义。
资源详情
资源推荐
第 31 卷 第 4 期
广东海洋大学学报 Vo l. 3 1 No.4
2011 年 8 月 Journal of Guangdong Ocean University Aug. 2011
收稿日期:2011-08-02
基金项目:广东省自然科学基金(9452408801002439);湛江市科技计划项目
作者简介:李亚(1978-),女,硕士,从事昆虫生物防治。E-mail:freebirdliya@163.com。
金龟子绿僵菌甘露糖 6-磷酸异构酶基因
cDNA 序列的克隆及分析
李 亚
(广东海洋大学农学院,广东 湛江,524088)
摘 要:通过绿僵菌属甘露糖 6-磷酸异构酶基因保守核苷酸区域设计简并性引物,采用 RT-PCR 及 RACE-PCR 技
术成功克隆了金龟子绿僵菌 mpi 基因 cDNA 序列。该基因 cDNA 序列全长为 1 513 bp,开放阅读框长度为 1 328 bp,
共编码 441 氨基酸。BLAST 分析发现该基因演绎的氨基酸序列与其它真菌同源性较高,蛋白结构分析表明 MPI 蛋
白是较保守的蛋白磷酸酶结构特征,主要由α螺旋和不规则卷曲构成。
关键词:金龟子绿僵菌;RACE;甘露糖 6-磷酸异构酶基因;克隆
中图分类号:Q78 文献标志码:A 文章编号:1673-9159(2011)04-0017-06
Cloning and Sequence Analysis of Mannose-6-phosphate Isomerase cDNA from
Metarhizium anisopliae ZJ1109
LI Ya
( Agricultural College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China)
Abstract: The primers were designed according to the conservative sequence of mannose-6-phosphate
isomerase gene, and the complete cDNA sequence of Metarhizium anisopliae was amplified by RT-PCR
and RACE PCR. The complete cDNA sequence of mpi gene was 1513 bp and the complete ORF length
was 1328 bp which encoded a protein with 441 amino acid residues. Blast analysis indicated the deduced
amino acid sequence of the mpi gene from M. anisopliae showed high homology with other fungi
respectively. The analysis of protein structure showed MPI protein had the characteristic of the
conservative phosphate enzyme, and mainly constructed by α-helix and random coil.
Key words: Metarhizium anisopliae; RACE; mannose-6-phosphate isomerase gene; cloning
[11] Rousset F. Genepop’007: A complete re-implementation of the
genepop software for Windows and Linux[J]. Molecular ecology
resources, 2008, 8(1): 103-106.
[12] Botstein D, White R L, Skolnick M, et al. Construction of a genetic
linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms
[J]. American journal of human genetics, 1980, 32 (3): 314-331.
[13] Crollius H R, Jaillon O, Dasilva C, et al. Characterization and repeat
analysis of the compact genome of the freshwater pufferfish
Tetraodon nigroviridis[J]. Genome Research, 2000, 10 (7): 939.
[14] Edwards Y J K, Elgar G, Clark M S, et al. The identification and
characterization of microsatellites in the compact genome of the
Japanese pufferfish, Fugu rubripes: perspectives in functional and
comparative genomic analyses1[J]. Journal of molecular biology,
1998, 278 (4): 843~854.
[15] Li B, Xia Q, Lu C, et al. Analysis on frequency and density of
microsatellites in coding sequences of several eukaryotic
genomes[J]. Genomics proteomics bioinformatics, 2004, 2 (1):
24-31.
[16] 李培. 南海海域五种笛鲷的 SSR 和 D-loop 序列分析[D]. 湛江:
广东海洋大学, 2011.
下载后可阅读完整内容,剩余5页未读,立即下载
weixin_38733414
- 粉丝: 11
- 资源: 987
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- C++多态实现机制详解:虚函数与早期绑定
- Java多线程与异常处理详解
- 校园导游系统:无向图实现最短路径探索
- SQL2005彻底删除指南:避免重装失败
- GTD时间管理法:提升效率与组织生活的关键
- Python进制转换全攻略:从10进制到16进制
- 商丘物流业区位优势探究:发展战略与机遇
- C语言实训:简单计算器程序设计
- Oracle SQL命令大全:用户管理、权限操作与查询
- Struts2配置详解与示例
- C#编程规范与最佳实践
- C语言面试常见问题解析
- 超声波测距技术详解:电路与程序设计
- 反激开关电源设计:UC3844与TL431优化稳压
- Cisco路由器配置全攻略
- SQLServer 2005 CTE递归教程:创建员工层级结构
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功