micapipe实验室开发的多模式MRI图像分析工具

资源摘要信息:"micapipe是一个多模式成像和连接组分析实验室开发的工具，其主要目标是处理MRI图像并生成可用于连接组分析的数据。它是由麦吉尔大学开发，主要应用于麦康奈尔脑成像中心。 micapipe的主要优点包括： 1. 微观结构轮廓协方差：这是一种先进的分析技术，可以揭示大脑微观结构的细微变化。 2. 多个分割（18 x 3）：这意味着该工具可以对大脑进行多个不同层面的分割，从而提供更详细的大脑图像。 3. 包括小脑和皮层下区域：这使得micapipe能够提供更全面的大脑图像，包括通常被忽视的小脑和皮层下区域。 4. 基于表面的分析：这是一种更精确的大脑图像分析方法。 5. 最新版本的软件依赖项：这意味着micapipe使用的是当前最新版本的软件，可以提供更好的性能和更少的错误。 6. 准备使用输出：micapipe可以直接输出可用于进一步分析的数据，无需额外的处理。 7. 易于使用：该工具设计用户友好，即使是没有经验的用户也可以轻松使用。 8. 标准化格式（BIDS）：micapipe使用BIDS（脑成像数据结构）格式，这是一种开放的、社区驱动的格式，用于组织和共享神经影像数据和元数据。 micapipe的依赖关系包括： 1. dcm2niix：这是一个将DICOM文件转换为NIfTI文件的工具，版本为v1.0.20190902。 2. FSl：这是一个用于神经影像处理的软件包，版本为6.0.0。 3. MRtrix3：这是一个用于处理扩散磁共振成像（dMRI）数据的软件，版本为3.0.1。 micapipe支持的MRI图像类型包括： 1. T1加权图像：这是一种常用的MRI图像类型，可以提供大脑的详细结构图像。 2. 静止状态fMRI：这是一种测量大脑活动的技术，可以在大脑静止时测量其活动。 3. 扩散加权图像：这是一种特殊的MRI图像，可以测量水分子在大脑中的扩散，从而提供大脑微观结构的信息。 micapipe是一个半灵活且健壮的框架，可以处理各种大脑图谱，并生成基于模态的可随时使用的连接体。其基本尖端处理是针对T1加权图像，静止状态fMRI和扩散加权图像。" 标签: "awesome mri neuroimaging imageprocessing bids microstructure diffusion-mri connectome resting-state multimodal Shell" 压缩包子文件的文件名称列表: "micapipe-master"