人PSF蛋白结合的长非编码RNA筛选与鉴定研究

"人PSF蛋白结合长非编码RNA的筛选及鉴定 (2011年)" 这篇论文发表于2011年7月的《四川大学学报(自然科学版)》第48卷第4期，主要研究了人PSF（human poly-pyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor）蛋白与长非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）之间的相互作用。PSF是一种参与RNA剪接过程的重要蛋白质，而lncRNA虽然不编码蛋白质，但对基因表达调控起着关键作用。 研究方法采用了RNA亲和层析（RNA affinity chromatography），这是一种技术，用于从细胞核RNA文库中筛选出能与特定蛋白质结合的RNA分子。在人黑色素瘤细胞YUSAC的细胞核RNA中，研究人员发现四种可能与PSF蛋白相互作用的lncRNA片段。这些片段分别位于内源性逆转座子LIPA16、MER11C、非编码基因MALAT-1以及一个尚未被充分识别的基因上。 进一步的实验，如紫外交联分析（UV cross-linking assay）和RNA免疫沉淀（RNA immunoprecipitation, RNA-IP），证实了这四种lncRNA片段在体内外都能与PSF蛋白形成复合物。特别是，通过半定量RT-PCR（reverse transcription polymerase chain reaction）分析，发现未知lncRNA在人黑色素瘤细胞中具有特异性且高水平的表达，而其他三种lncRNA在多种肿瘤细胞中的表达量相比正常细胞显著增加。 这项研究揭示了PSF蛋白与lncRNA之间的新型相互作用，可能在人类肿瘤的发生发展中起着重要作用。lncRNA的异常表达可能影响PSF的功能，从而影响基因表达和细胞的生理病理状态。这些发现为理解肿瘤发生机制和潜在治疗靶点提供了新的视角。