图神经网络异质图结构学习深入解析

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资源摘要信息:"人工智能AI源代码解析-图神经网络的异质图结构学习" 人工智能(AI)是计算机科学的一个分支,它试图理解智能的本质并生产出一种新的能以人类智能行为方式做出反应的智能机器。神经网络是一种旨在模仿人脑结构和功能的计算系统,它们可以学习识别数据中的模式。图神经网络(GNN)是神经网络的一个子领域,特别适合处理图结构数据。异质图是图结构的一种,其中节点和边可以属于不同的类型。异质图结构学习(Heterogeneous Graph Structure Learning,HGSL)关注于如何让神经网络学习图中不同实体和关系的复杂结构。 图神经网络(GNN)的基本知识包括: - 图表示学习:GNN的目标是学习图中节点的低维表示,这种表示能够捕捉节点的本地和全局结构信息。 - 消息传递机制:GNN的核心是通过节点之间的消息传递过程来迭代更新节点的表示。 - 节点分类和链接预测:利用学习到的节点表示可以解决多种下游任务,如节点分类和链接预测。 异质图结构学习(HGSL)的知识点涵盖: - 节点和边类型区分:在异质图中,节点和边可以属于不同的类别,例如在社交网络中,节点可以是人、地点或事件,边可以是朋友关系、地理位置或时间序列关系。 - 元路径和元图:元路径定义了从一个节点类型到另一个节点类型的一条路径,元图则是由节点和边按照元路径构成的子图。 - 多类型关系学习:HGSL需要学习不同类型节点和边之间的关系,这对于理解图的复杂结构至关重要。 在解析源代码时,需要关注的关键知识点包括: - 数据预处理:在图神经网络模型训练之前,如何有效地处理和准备异质图数据,例如节点和边的嵌入表示。 - 模型架构:理解GNN模型的设计,特别是如何在模型中处理和融合异质图中的不同类型信息。 - 训练策略:掌握如何训练HGSL模型,包括损失函数的选择、优化算法和正则化技巧。 - 实际应用:分析模型如何应用于具体任务,例如个性化推荐、知识图谱构建和复杂网络分析。 通过HGSL-main文件的分析,可以深入了解如何实现异质图结构学习。HGSL-main可能包含: - 模型定义文件:其中包括构建图神经网络模型的类和函数。 - 训练脚本:包含训练模型的代码,如数据加载、模型训练和评估流程。 - 实验结果:展示模型在不同任务上的性能指标,以及与其他方法的比较。 - 应用示例:提供如何将模型应用于具体场景的代码和指南。 针对这个领域的研究者和工程师,深入理解和掌握HGSL的原理与应用将有助于开发出更强大和智能化的系统,特别是在需要处理和理解复杂网络结构的领域中。随着技术的不断发展,对异质图结构学习的研究也将继续推动人工智能技术的边界。
2019-03-04 上传
# GPF ## 一、GPF(Graph Processing Flow):利用图神经网络处理问题的一般化流程 1、图节点预表示:利用NE框架,直接获得全图每个节点的Embedding; 2、正负样本采样:(1)单节点样本;(2)节点对样本; 3、抽取封闭子图:可做类化处理,建立一种通用图数据结构; 4、子图特征融合:预表示、节点特征、全局特征、边特征; 5、网络配置:可以是图输入、图输出的网络;也可以是图输入,分类/聚类结果输出的网络; 6、训练和测试; ## 二、主要文件: 1、graph.py:读入图数据; 2、embeddings.py:预表示学习; 3、sample.py:采样; 4、subgraphs.py/s2vGraph.py:抽取子图; 5、batchgraph.py:子图特征融合; 6、classifier.py:网络配置; 7、parameters.py/until.py:参数配置/帮助文件; ## 三、使用 1、在parameters.py中配置相关参数(可默认); 2、在example/文件夹中运行相应的案例文件--包括链接预测、节点状态预测; 以链接预测为例: ### 1、导入配置参数 ```from parameters import parser, cmd_embed, cmd_opt``` ### 2、参数转换 ``` args = parser.parse_args() args.cuda = not args.noCuda and torch.cuda.is_available() torch.manual_seed(args.seed) if args.cuda: torch.cuda.manual_seed(args.seed) if args.hop != 'auto': args.hop = int(args.hop) if args.maxNodesPerHop is not None: args.maxNodesPerHop = int(args.maxNodesPerHop) ``` ### 3、读取数据 ``` g = graph.Graph() g.read_edgelist(filename=args.dataName, weighted=args.weighted, directed=args.directed) g.read_node_status(filename=args.labelName) ``` ### 4、获取全图节点的Embedding ``` embed_args = cmd_embed.parse_args() embeddings = embeddings.learn_embeddings(g, embed_args) node_information = embeddings #print node_information ``` ### 5、正负节点采样 ``` train, train_status, test, test_status = sample.sample_single(g, args.testRatio, max_train_num=args.maxTrainNum) ``` ### 6、抽取节点对的封闭子图 ``` net = until.nxG_to_mat(g) #print net train_graphs, test_graphs, max_n_label = subgraphs.singleSubgraphs(net, train, train_status, test, test_status, args.hop, args.maxNodesPerHop, node_information) print('# train: %d, # test: %d' % (len(train_graphs), len(test_graphs))) ``` ### 7、加载网络模型,并在classifier中配置相关参数 ``` cmd_args = cmd_opt.parse_args() cmd_args.feat_dim = max_n_label + 1 cmd_args.attr_dim = node_information.shape[1] cmd_args.latent_dim = [int(x) for x in cmd_args.latent_dim.split('-')] if len(cmd_args.latent_dim) == 1: cmd_args.latent_dim = cmd_args.latent_dim[0] model = classifier.Classifier(cmd_args) optimizer = optim.Adam(model.parameters(), lr=args.learningRate) ``` ### 8、训练和测试 ``` train_idxes = list(range(len(train_graphs))) best_loss = None for epoch in range(args.num_epochs): random.shuffle(train_idxes) model.train() avg_loss = loop_dataset(train_graphs, model, train_idxes, cmd_args.batch_size, optimizer=optimizer) print('\033[92maverage training of epoch %d: loss %.5f acc %.5f auc %.5f\033[0m' % (epoch, avg_loss[0], avg_loss[1], avg_loss[2])) model.eval() test_loss = loop_dataset(test_graphs, model, list(range(len(test_graphs))), cmd_args.batch_size) print('\033[93maverage test of epoch %d: loss %.5f acc %.5f auc %.5f\033[0m' % (epoch, test_loss[0], test_loss[1], test_loss[2])) ``` ### 9、运行结果 ``` average test of epoch 0: loss 0.62392 acc 0.71462 auc 0.72314 loss: 0.51711 acc: 0.80000: 100%|███████████████████████████████████| 76/76 [00:07<00:00, 10.09batch/s] average training of epoch 1: loss 0.54414 acc 0.76895 auc 0.77751 loss: 0.37699 acc: 0.79167: 100%|█████████████████████████████████████| 9/9 [00:00<00:00, 34.07batch/s] average test of epoch 1: loss 0.51981 acc 0.78538 auc 0.79709 loss: 0.43700 acc: 0.84000: 100%|███████████████████████████████████| 76/76 [00:07<00:00, 9.64batch/s] average training of epoch 2: loss 0.49896 acc 0.79184 auc 0.82246 loss: 0.63594 acc: 0.66667: 100%|█████████████████████████████████████| 9/9 [00:00<00:00, 28.62batch/s] average test of epoch 2: loss 0.48979 acc 0.79481 auc 0.83416 loss: 0.57502 acc: 0.76000: 100%|███████████████████████████████████| 76/76 [00:07<00:00, 9.70batch/s] average training of epoch 3: loss 0.50005 acc 0.77447 auc 0.79622 loss: 0.38903 acc: 0.75000: 100%|█████████████████████████████████████| 9/9 [00:00<00:00, 34.03batch/s] average test of epoch 3: loss 0.41463 acc 0.81132 auc 0.86523 loss: 0.54336 acc: 0.76000: 100%|███████████████████████████████████| 76/76 [00:07<00:00, 9.57batch/s] average training of epoch 4: loss 0.44815 acc 0.81711 auc 0.84530 loss: 0.44784 acc: 0.70833: 100%|█████████████████████████████████████| 9/9 [00:00<00:00, 28.62batch/s] average test of epoch 4: loss 0.48319 acc 0.81368 auc 0.84454 loss: 0.36999 acc: 0.88000: 100%|███████████████████████████████████| 76/76 [00:07<00:00, 10.17batch/s] average training of epoch 5: loss 0.39647 acc 0.84184 auc 0.89236 loss: 0.15548 acc: 0.95833: 100%|█████████████████████████████████████| 9/9 [00:00<00:00, 28.62batch/s] average test of epoch 5: loss 0.30881 acc 0.89623 auc 0.95132 ```