德塔自然语言图灵系统与DNA计算 - 第5修订版

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"DNA元基催化与肽计算_第5修订版本V00051021" 本书详细探讨了多种计算机科学与信息技术在自然语言处理、数据分析、人工智能及数据库管理等多个领域的应用。以下是各章节的主要知识点: 1. **第一章_德塔自然语言图灵系统** - **德塔分词的催化切词优化方式**:本章介绍了德塔算法在分词上的优化技术,通过催化切词提高分词效率和准确性。 - **分词**:讨论了如何将文本分割成有意义的词语,这是自然语言处理的基础。 - **排序**:在分词后的词汇进行排序,有助于后续处理和索引。 - **神经网络索引**:利用神经网络建立高效的文本索引,提升查询速度。 - **动态POS函数流水阀门细化遍历内核匹配**:介绍了一种动态标注词汇部分-of-speech(POS)的方法,用于更精细化的语言理解。 2. **第二章Java数据分析算法引擎系统** - **微分催化排序**:提出了一种新的排序算法,结合微分计算和催化原理。 - **计算力与算能优化的思想手稿**:探讨如何提高计算效率和计算能力。 - **线性与非线性**:涵盖了线性和非线性数据分析方法。 - **EtlUnicorn对音频卷积处理**:利用EtlUnicorn工具处理音频数据,可能涉及音频信号的卷积操作。 - **排序与搜索**:在数据处理中,排序和搜索是基本操作。 3. **第三章德塔ETL人工智能可视化数据流分析引擎系统** - **可视化界面**:讨论了用户友好的数据流分析界面设计。 - **流存储与节点**:介绍流式数据处理和节点在网络中的作用。 - **插件与档案**:讨论了扩展系统功能的插件和数据管理。 - **拓扑与神经网络**:探讨了数据流的拓扑结构和神经网络的应用。 4. **第四章德塔Socket流可编程数据库语言引擎系统** - **SocketrestTCP握手协议**:涉及网络通信中的Socket、REST和TCP协议交互。 - **文件数据库**:讨论了文件为基础的数据库系统。 - **VPCS服务器与调度架构**:介绍虚拟化控制平台服务器及其调度策略。 - **PLSQL语言与编译机**:讲解PL/SQL这种数据库编程语言及其编译机制。 - **PLORM语言**:可能是一种针对对象关系映射的数据库语言。 - **灾后重建**:讨论了数据库系统的恢复和灾难应对策略。 5. **第五章_德塔数据结构变量快速转换** - **内存结构、数据结构与类结构**:深入到计算机内存管理和数据组织。 - **转换加速**:探讨如何优化数据转换过程以提高速度。 - **不规则对象的变换**:处理非标准或复杂数据结构的转换问题。 - **场景变换**:可能是指在特定上下文下的数据变换。 6. **第六章_数据预测引擎系统** - **坐标系统预测**:预测模型在地理空间数据中的应用。 - **环境预测**:利用数据预测环境变化或影响。 - **雷达机与状态机**:介绍了预测模型的构建和监控工具。 - **离散模型预测、概率机、向量机**:涵盖多种预测模型和算法,如离散事件模拟、概率模型和支持向量机。 - **商旅TSP**:旅行商问题(TSP)在商业路线规划中的应用。 - **眼睛团坐标识别**:可能涉及图像处理中的眼部特征识别。 7. **第七章类人DNA与神经元基于催化算子映射编码方式** - **类人认知模拟**:讨论了模拟人类认知过程的算法和系统。 - **DETAhumanoidcognitionhistory, development, application**:涵盖了该领域的发展历程、技术实现和实际应用。 这些章节的内容展示了信息技术在处理自然语言、数据处理、人工智能和数据库管理等领域的深度应用和创新。每章都包含了丰富的理论和技术细节,适合对相关领域有深入研究的读者。

def repair_dna(self, dna_sequence, accessor, start_index, vt_check=None, max_consec = 4, max_error = 6): """ Repair the DNA sequence containing one (or more) errors. 默认有indel :return: repaired DNA sequence set and additional information. :rtype: list, at least have one item """ def recursive_repair(dna_sequence, location, start_index, consec, error): # recursion stop if consec > max_consec or error > max_error: return [] elif location == len(dna_sequence): return [(dna_sequence, consec, error)] # get variables results = [] nucleotides = "ACGT" used_indices, current_nucleotide = np.where(accessor[start_index] >= 0)[0], dna_sequence[location] used_nucleotides = [nucleotides[used_index] for used_index in used_indices] # match if current_nucleotide in used_nucleotides: results.extend(recursive_repair(dna_sequence, location + 1, accessor[start_index][nucleotides.index(current_nucleotide)]), 0, error) # substitution for nucleotide in used_nucleotides: if nucleotide != current_nucleotide: results.extend(recursive_repair(dna_sequence, location + 1, accessor[start_index][nucleotides.index(nucleotide)]), consec + 1, error + 1) # insertion results.extend(recursive_repair(dna_sequence[:location] + dna_sequence[location + 1:], location, accessor[start_index][nucleotides.index(nucleotide)]), consec + 1, error + 1) # deletion for nucleotide in used_nucleotides: results.extend(recursive_repair(dna_sequence[:location] + nucleotide + dna_sequence[location + 1:], location + 1, accessor[start_index][nucleotides.index(nucleotide)]), consec + 1, error + 1) return results

2023-07-17 上传