LSF(Load Sharing Facility)是分布式批处理系统,主要用于在多台计算机上高效管理和调度计算任务,特别是在高性能计算(HPC)环境中。本文档是对LSF使用的一次综述,主要涵盖以下几个关键知识点:
1. **设置LSF环境变量**:
在Linux系统中,用户通过`%loginas`命令登录并查看环境变量,如`LSF_SERVERDIR`、`LSF_LIBDIR`、`LSF_VERSION`等,这些变量存储了LSF的核心配置路径和版本信息,对于系统的正确配置至关重要。
2. **作业提交与管理**:
- **Gauss作业**:用户使用`bsub`命令提交作业,通过提供特定的关键字(如`g03.lsf`)来指定作业类型和参数。例如,`-W60`表示作业最多运行60分钟,`-n32`指定了需要32个CPU核心。此外,`output.%J`是一个隐藏参数,用于指定标准输出和错误报告文件名。
- **Dock作业**:另一种作业提交方式是针对Dock应用程序,如`bsub`命令中包含`-aopenmpi`参数,指定使用OpenMPI并指定执行脚本和输出文件路径。
3. **资源管理**:
LSF可以根据队列策略(`-q`选项)动态分配资源,如`-qQN_Norm`指定了作业提交到名为`QN_Norm`的队列,队列策略有助于平衡负载和性能需求。
4. **系统监视**:
提交作业后,用户需要定期监控作业状态,可以通过LSF提供的工具或命令行接口了解作业的运行情况,包括运行时间、资源使用、进度等。
5. **故障分析**:
文档可能还涉及到故障排查技巧,如当作业出现异常时,如何检查日志文件、环境配置以及可能的资源限制等问题。
6. **讨论与其它**:
最后一部分可能是对常见问题的讨论,如LSF与其他批处理系统(如Slurm或PBS)的比较,以及如何优化LSF配置以适应特定的计算环境。
这是一份全面的LSF使用指南,涵盖了从环境配置、作业提交到故障解决的方方面面,对于初次接触LSF或者希望深入了解其功能的用户来说非常实用。通过学习和实践,可以有效提升高性能计算任务的管理和执行效率。