Matlab实现PCA特征提取及其依赖工具介绍

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资源摘要信息:"PCA特征提取的MATLAB代码-cmsc773:cmsc773" PCA(主成分分析)特征提取是一种常用的数据降维技术,它通过正交变换将可能相关的变量转换为一组线性不相关的变量,这些变量称为主成分。PCA的目标是使得数据的方差最大化,同时确保新变量之间的独立性。在机器学习和模式识别领域,PCA常用于数据预处理阶段,以便减少模型训练的时间和提高模型的可解释性。 在本资源中,提到了一个关于PCA特征提取的MATLAB代码库,该项目被命名为cmsc773。该代码库不仅涉及MATLAB脚本,还涉及了其他编程语言和工具链的依赖关系,具体如下: 1. Python(版本>=2.6且<3.0):Python是该项目的主要编程语言之一,用于编写大多数脚本。 2. NLTK(任何最新版本):自然语言处理工具包,用于数据预处理。 3. GNU工具链(包括gcc、autoconf、make等):用于代码的编译和构建过程。 4. liblbfgs:一个实现了限制内存的Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno算法的库,可能用于优化问题的求解。 5. OCaml:一种编程语言,用于构建某些组件。 6. g++(版本>=4.4):用于编译C++代码,构建最大和潜在模型实现。 7. 标准UNIX实用程序:如grep、sort、uniq、cat、sh等,这些工具在数据处理和脚本编写中经常使用。 8. seq:GNU coreutils的一部分,用于处理序列数据。需要注意的是,BSD coreutils中没有seq,因此在Mac OS X上默认不可用。 9. Matlab(任何最新版本):用于特征提取的软件工具。 此外,代码库的目录结构包括以下几个部分: - common.py:包含一些对所有人都有用的通用工具。 - feateng/:包含与特征工程相关的内容。 - preprocess/:包含数据预处理相关的脚本和工具,例如数据清洗等。 - coarsefine/:包含用于粗分类的脚本。 - maxent/:包含使用liblbfgs库实现的Maximum Entropy(MaxEnt)和潜在模型相关的脚本。 标签"系统开源"表明该项目是开源的,这意味着任何人都可以查看和修改代码,也可以使用它来执行PCA特征提取操作。 压缩包子文件的文件名称列表显示的"cmsc773-master"表明,这是一个主分支的项目,用户应该从这个目录中查找相关的MATLAB代码文件。通过这些文件,用户可以学习和实现PCA特征提取,并将其应用于解决实际问题。 在使用本资源时,用户需要确保他们的计算环境中已安装所有必要的工具和依赖项。在运行MATLAB代码之前,用户还需要理解PCA的数学原理和MATLAB编程基础知识,以便更好地理解和调试代码。通过本资源的使用,用户可以加深对PCA特征提取方法及其在数据处理中应用的理解,并能将其应用于机器学习、统计分析和其他数据分析任务中。

index0 = numerical_corr.sort_values(ascending=False).index 36 print(train_data_scaler[index0].corr('spearman')) 37 38 new_numerical=['V0', 'V2', 'V3', 'V4', 'V5', 'V6', 'V10','V11', 39 'V13', 'V15', 'V16', 'V18', 'V19', 'V20', 'V22','V24','V30', 'V31', 'V37'] 40 X=np.matrix(train_data_scaler[new_numerical]) 41 VIF_list=[variance_inflation_factor(X, i) for i in range(X.shape[1])] 42 VIF_list 43 44 45 pca = PCA(n_components=0.9) 46 new_train_pca_90 = pca.fit_transform(train_data_scaler.iloc[:,0:-1]) 47 new_test_pca_90 = pca.transform(test_data_scaler) 48 new_train_pca_90 = pd.DataFrame(new_train_pca_90) 49 new_test_pca_90 = pd.DataFrame(new_test_pca_90) 50 new_train_pca_90['target'] = train_data_scaler['target'] 51 new_train_pca_90.describe() 52 53 pca = PCA(n_components=0.95) 54 new_train_pca_16 = pca.fit_transform(train_data_scaler.iloc[:,0:-1]) 55 new_test_pca_16 = pca.transform(test_data_scaler) 56 new_train_pca_16 = pd.DataFrame(new_train_pca_16) 57 new_test_pca_16 = pd.DataFrame(new_test_pca_16) 58 new_train_pca_16['target'] = train_data_scaler['target'] 59 new_train_pca_16.describe() 60 61 from sklearn.ensemble import GradientBoostingRegressor 62 63 from sklearn.model_selection import learning_curve 64 from sklearn.model_selection import ShuffleSplit 65 66 new_train_pca_16 = new_train_pca_16.fillna(0) 67 train = new_train_pca_16[new_test_pca_16.columns] 68 target = new_train_pca_16['target'] 69 70 train_data,test_data,train_target,test_target=train_test_split(train,target,test_size=0.2,random_state=0) 71 72 clf = LinearRegression() 73 clf.fit(train_data, train_target) 74 score = mean_squared_error(test_target, clf.predict(test_data)) 75 print("LinearRegression: ", score) 76 77 train_score = [] 78 test_score = []解释每一句代码的意思

2023-06-16 上传
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