派-曙光高性能计算机用户使用手册 V1.0

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"曙光read_file.pdf 是一份关于曙光超级计算机的用户使用手册,涵盖了系统用户环境、编译环境和作业调度软件的使用指南。手册详细介绍了如何登录、使用shell环境、管理用户目录、编译各类程序以及如何进行作业调度。" 在曙光高性能计算机中,用户可以有两种登录方式,分别是针对业务用户的“piop.nmic.cn”和针对科研用户的“pird.nmic.cn”,系统采用安全的SSH协议提供登录服务。一旦用户成功登录,系统默认的shell环境为bash,但用户可以根据需要使用`chsh`命令更改shell环境,例如切换到csh。 用户的主要工作空间位于其主目录$HOME,通常位于/g1/u/用户名下。此外,还有一个用户数据目录$WORKDIR,用于存储用户数据。系统还提供了$JOBDIR作为作业运行的临时空间。在执行编译等任务时,每个节点的/scratch目录可供临时使用,但应避免使用系统的/tmp文件系统,因为这可能不是持久或安全的存储位置。 在编译环境中,手册详细讲解了如何编译串行程序、OpenMP并行程序以及MPI并行程序。对于串行程序,用户可以直接使用常规的编译器。OpenMP并行程序则需要开启特定的编译选项以支持并行计算。MPI并行程序的编译需要使用MPI库,如OpenMPI或MVAPICH2,并相应设置编译器标志。手册还列出了一些常用的编译选项和调试选项,帮助用户优化代码性能和定位问题。 在作业调度方面,曙光超级计算机使用了一种作业调度软件,用户可以通过`sinfo`查询队列信息,使用`sbatch`提交批处理作业,`squeue`查看作业状态,`scontrol`获取更详细的作业和节点信息,以及使用`scancel`来取消作业。手册还给出了两个作业提交脚本的示例,一个是处理作业依赖关系的示例,另一个是适用于气候模式运行的脚本。 附件1包含了一份应用软件安装信息表,提供了更多关于系统上可用软件的详细信息。整体来看,这份手册为曙光超级计算机的用户提供了一个全面的操作指南,便于他们高效地利用这台高性能计算资源。
2023-04-13 上传