苏太猪FUT1基因启动子甲基化与mRNA表达的年龄关联研究

本研究论文深入探讨了苏太猪从出生到断奶阶段，不同年龄仔猪十二指肠中FUT1基因启动子区的甲基化状态及其与mRNA表达的关系。由郑先瑞、王靖等人进行的研究，利用亚硫酸氢盐测序（Bisulfite Sequencing PCR，BSP）和荧光定量PCR技术，对FUT1基因上游调控区域进行了细致的分析。 首先，研究发现FUT1基因调控区包含两个CpG岛，这是DNA序列中的特定区域，富含胞嘧啶和鸟嘌呤，其甲基化状态可能影响基因的表达。此外，该区域还具有启动子的典型特征，如CAAT box（一种常见的启动子元件）以及早期启动子元件（EARLY-SEQ1）和SP1等转录因子结合位点，这些转录因子对基因转录起关键作用。 实验结果显示，非CpG岛区从-2174到-1762碱基对区域表现出高度甲基化，且在不同日龄段仔猪间无显著差异，这表明非甲基化状态在FUT1基因表达中可能扮演辅助而非主导角色。然而，CpG岛区，即-1762到-580碱基对区段的甲基化程度较低，且随着仔猪年龄的增长，35日龄组的甲基化程度显著低于8日龄和18日龄，这提示甲基化水平可能与FUT1基因的活性呈现负相关关系。 FUT1基因的表达分析进一步证实了这一结论，35日龄仔猪的FUT1基因表达明显高于18和8日龄组，这与甲基化程度降低相一致。通过相关性分析，研究者发现CpG岛的甲基化程度与mRNA的表达量呈显著负相关，这意味着较高的甲基化水平会抑制FUT1基因的转录，从而影响其功能。 总结来说，这项研究揭示了在猪十二指肠中，非CpG岛区的甲基化对FUT1基因的表达影响较小，而CpG岛的甲基化则在一定程度上起到了负调控作用。这对于理解FUT1基因在仔猪肠道中的表达调控机制以及其对抗F18大肠杆菌抗性的生物学意义具有重要价值。未来的研究可以进一步探索如何通过调节CpG岛甲基化来调控FUT1基因的功能，以优化猪的健康和生产性能。