猪FUT1基因启动子克隆与序列分析

"猪α（1, 2）岩藻糖转移酶（FUT1）基因启动子区克隆及序列分析" 这篇论文是关于猪α（1, 2）岩藻糖转移酶（FUT1）基因启动子区的研究，由杜子栋等人完成，并标记为"首发论文"。该研究的目的是探索猪FUT1基因的启动子区域以及其转录调控机制，这对于理解基因表达控制和猪的抗病育种具有重要意义。 研究方法包括使用5'-RACE（5'末端快速扩增cDNA末端）技术，成功扩增出一段2023碱基对（bp）的FUT1基因上游序列。通过比对Genebank中的序列U70883.2和BAC文库中的CU929759.7，研究人员确定了转录起始位点位于起始密码子上游约-2400bp的位置。 进一步的分析集中在转录起始位点上游-400bp的启动子特征分析和下游1789bp的CpG岛预测。生物信息学结果显示，转录起始位点上游-20bp处存在一个TA框，这可能是一个重要的启动子元件。此外，CpG岛分析揭示在第一外显子（5'非编码区）有长度超过1000bp的CpG岛，这些CpG岛在基因表达调控中扮演重要角色，因为它们可以影响DNA甲基化状态，从而影响基因活性。 在转录起始位点上游-1200bp区域，研究发现有Ik-2、c-Ets和ELK-1等转录因子的结合位点，暗示这个区域可能存在多个转录因子的相互作用，是基因转录调控的关键区域。这些转录因子可能参与了FUT1基因的激活或抑制过程。 综合以上结果，论文得出结论，FUT1基因启动子区域的上游-20bp处的TA框很可能是一个启动子结构，而-1200bp区域富含转录因子结合位点，可能是基因表达调控的关键区域。CpG岛的存在和序列特征分析进一步支持了这一观点。这些发现为后续的功能验证实验和猪的遗传改良提供了理论依据。 关键词：FUT1基因；启动子区；序列分析；5'-RACE；CpG岛；转录因子