猪FUT1基因启动子克隆与序列分析
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更新于2024-09-04
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"猪α(1, 2)岩藻糖转移酶(FUT1)基因启动子区克隆及序列分析"
这篇论文是关于猪α(1, 2)岩藻糖转移酶(FUT1)基因启动子区的研究,由杜子栋等人完成,并标记为"首发论文"。该研究的目的是探索猪FUT1基因的启动子区域以及其转录调控机制,这对于理解基因表达控制和猪的抗病育种具有重要意义。
研究方法包括使用5'-RACE(5'末端快速扩增cDNA末端)技术,成功扩增出一段2023碱基对(bp)的FUT1基因上游序列。通过比对Genebank中的序列U70883.2和BAC文库中的CU929759.7,研究人员确定了转录起始位点位于起始密码子上游约-2400bp的位置。
进一步的分析集中在转录起始位点上游-400bp的启动子特征分析和下游1789bp的CpG岛预测。生物信息学结果显示,转录起始位点上游-20bp处存在一个TA框,这可能是一个重要的启动子元件。此外,CpG岛分析揭示在第一外显子(5'非编码区)有长度超过1000bp的CpG岛,这些CpG岛在基因表达调控中扮演重要角色,因为它们可以影响DNA甲基化状态,从而影响基因活性。
在转录起始位点上游-1200bp区域,研究发现有Ik-2、c-Ets和ELK-1等转录因子的结合位点,暗示这个区域可能存在多个转录因子的相互作用,是基因转录调控的关键区域。这些转录因子可能参与了FUT1基因的激活或抑制过程。
综合以上结果,论文得出结论,FUT1基因启动子区域的上游-20bp处的TA框很可能是一个启动子结构,而-1200bp区域富含转录因子结合位点,可能是基因表达调控的关键区域。CpG岛的存在和序列特征分析进一步支持了这一观点。这些发现为后续的功能验证实验和猪的遗传改良提供了理论依据。
关键词:FUT1基因;启动子区;序列分析;5'-RACE;CpG岛;转录因子
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2021-05-13 上传
2020-03-09 上传
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2020-01-03 上传
2019-12-27 上传
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