基于MATLAB的雪崩睡眠fMRI幂律变换工具包
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更新于2024-11-07
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资源摘要信息:"matlab幂律变换代码-Avalanches_Sleep_fMRI_2019:雪崩_睡眠_fMRI_2019"
知识点:
1. MATLAB编程与应用领域:MATLAB是一种用于数值计算、可视化以及编程的高级语言和交互式环境,被广泛应用于工程计算、控制设计、数据分析等领域。本资源中的代码涉及的是在MATLAB环境下,针对雪崩现象及睡眠脑功能成像(fMRI)数据进行幂律变换分析的应用。
2. 雪崩模型与脑功能分析:雪崩模型是物理和神经科学领域中用来描述系统自组织临界性的一种模型。在睡眠状态下,脑活动可能表现出幂律分布的特性,即雪崩模式。幂律变换代码可帮助分析fMRI数据中反映出的这种自组织临界性。
3. fMRI数据处理:功能性磁共振成像(fMRI)是一种非侵入性地测量脑活动的技术,能够捕捉到与任务相关的血流变化。在本资源中,MATLAB代码应用于处理fMRI数据,以识别脑活动中的连续共同激活体素,并对这些信号进行分析。
4. 数据分析和处理功能:
- 'clusters_labeling':用于检测并标记连续共同激活的体素簇,这些簇是通过点过程变换后超阈值体素组成的。
- 'clusters2sparse':将簇标签的4D矩阵转换为稀疏表示形式,方便进一步处理。
- 'sparse2cell':将Nx5的2D矩阵稀疏表示转换为像素形式,常用于图像或数据可视化。
- 'get_cluster_sizes':根据簇标签的4D矩阵,获取簇的大小信息。
- 'coarse_graining':通过粗粒度方法实现数据的空间下采样,降低数据的复杂度和分辨率。
- 'phase_shuffling_4D':为4D矩阵中的时间序列添加随机相位,用于数据的随机化处理,常用于噪声或伪随机效应的控制。
- 'permutation_test':用于执行排列检验,比较两个分布的均值是否存在显著差异。
5. 辅助功能:
- 'std_4D':计算4D矩阵的标准差。
- 'zscore_4D':计算4D矩阵的z分数,即标准化分数,常用于去除量纲影响和进行归一化处理。
- 'get_position':根据3D位置信息获取单索引目标。
- 'phase_shuffling':为单个时间序列添加随机相位,用于时间序列分析中的随机化控制。
6. 开源系统与协作开发:标签中提到的“系统开源”表明此项目遵循开放源代码的协作开发模式。开源系统允许用户自由使用、修改和分发代码,并能与全球开发者共同合作,提高代码质量和应用的可靠性。
7. 文件结构与命名规范:资源压缩包文件名称为"Avalanches_Sleep_fMRI_2019-master",暗示这是一个主版本文件,可能包含了多个相关的脚本、函数和文档。通常,这种命名方式表明其中包含的代码是经过一系列开发和优化的核心版本。
该资源的详细解释显示了它在处理fMRI数据和分析幂律变换时使用的功能,以及它作为开源项目所采用的开发模式和协作精神。
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