Serratus-Summary-API-Athena:AWS Athena提供Serratus数据POC
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更新于2024-11-24
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资源摘要信息:"serratus-summary-api-athena是一个通过AWS Athena提供Serratus摘要数据的POC(概念验证)项目。Serratus项目可能与生物信息学领域有关,特别是与病毒家族的基因组数据分析相关。在描述中提到,原先使用的是AWS雅典娜(Athena),但现在已经转移到使用奥罗拉(Aurora)。这表明该项目可能已经经历了技术升级或平台迁移。
AWS Athena是一个无服务器交互式查询服务,允许用户对存储在Amazon S3中的表格数据进行分析。通过Athena,用户可以利用标准SQL语言查询数据,而无需管理任何基础设施,非常适合执行即席查询。该项目通过Athena提供的API接口,允许用户通过特定的URL路径访问病毒家族或特定病毒序列的摘要数据,同时允许用户对查询结果进行进一步的筛选,如设定相似度(identity)和得分(score)的范围。
具体来说,API提供了以下端点来查询Serratus摘要数据:
- `/family/<family>`:通过病毒家族的名称查询该家族的所有相关数据。
- `/family/Coronaviridae`:查询冠状病毒科(Coronaviridae)的所有相关数据。
- `/family/Coronaviridae?identityMin=80&identityMax=90`:在冠状病毒科的基础上,进一步筛选出与参考序列的相似度在80%至90%之间的数据。
- `/sequence/<sequence>`:通过特定的序列编号查询该序列的详细信息。
- `/sequence/AY874537_3000883`:查询序列编号为AY874537_3000883的序列详细信息。
- `/sequence/AY874537_3000883?scoreMin=50&scoreMax=100&identityMin=50&identityMax=100`:在查询特定序列编号的基础上,筛选出得分在50到100之间,相似度在50%到100%之间的数据。
项目的设置部分提到了使用了Elastic Beanstalk实例,这是一个用于部署和管理云应用程序的服务。通过Elastic Beanstalk,开发者可以快速地在AWS上部署应用程序,而无需关心底层基础设施的配置和管理。同时,项目还涉及到了CodePipeline,这是一个持续集成和持续部署的服务,用于自动化软件的构建、测试和部署。CodePipeline可以与Elastic Beanstalk集成,实现应用程序的快速迭代和部署。
IAM(Identity and Access Management)的角色和权限管理也是项目的一部分,其中提到了IAM arn:aws:iam::797308。IAM arn是一个特定的资源标识符,用于在AWS账户中唯一标识一个IAM实体(如用户、组、角色或资源)。通过IAM,可以实现对AWS资源访问权限的精确控制,确保只有授权的用户或服务才能访问特定的资源。
标签中提到了多个与AWS相关的技术栈,如expressjs(一个基于Node.js平台的Web开发框架)、aws-codepipeline(AWS的持续集成和持续部署服务)、aws-elastic-beanstalk(用于部署和管理应用程序的服务)、aws-athena(用于交互式查询Amazon S3中表格数据的服务)和JavaScript(一种广泛使用的编程语言)。这些标签表明该项目是一个Web应用,利用了AWS的云服务来提供后端数据处理和查询功能,并通过Web前端展示查询结果。
压缩包子文件的文件名称列表中仅包含了`serratus-summary-api-athena-main`,这表明当前提供的压缩包中可能只包含该项目的主要或源代码部分。在开发或部署此类项目时,通常还会涉及到其他文件,如配置文件、依赖文件、构建脚本等。由于没有列出这些文件,我们无法断定项目完整的文件结构和内容。"
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