CentOS6.5环境下VASP5.2安装全攻略
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更新于2024-09-08
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"这篇文章除了介绍如何在CentOS6.5环境下安装VASP5.2之外,还提到了使用的编译器 ICC2011 和 IFORT2011,以及配合使用的OpenMPI1.6.5。作者强调了`makefile`配置对于安装过程的重要性,并分享了编译器的安装细节,包括如何处理MKL库、关闭SELINUX,以及将编译器路径添加到环境变量中。此外,文章还提到了OpenMPI的安装步骤,特别提醒了一些可能遇到的问题。"
在安装VASP(Vienna Ab initio Simulation Package)进行第一性原理计算时,本文提供了一套详细的安装流程,适用于高性能计算和科学计算模拟。首先,作者选择了基于CentOS6.5的操作系统,搭配Intel的编译器ICC2011和IFORT2011,这两个编译器包含的Math Kernel Library (MKL)对于科学计算至关重要。在安装过程中,需要注意的是,由于ICC和IFORT各自带有MKL,因此需确保不混淆使用。在安装编译器时,可能遇到SELINUX兼容性问题,按照提示关闭SELINUX并继续安装,最后将编译器路径添加到环境变量中。
接着,文章提到C语言编译器推荐使用ICC,因为它是Intel针对自家CPU优化的,能提高编译效率。验证编译器是否安装成功,可以通过`which`命令检查其路径。
然后,作者指出OpenMPI的安装是一个需要注意的环节。OpenMPI是实现分布式计算的重要组件,用于并行计算。安装OpenMPI时,需要使用特定的编译器选项,如`CC=icc`、`CXX=icpc`和`F77=ifort`,这确保了OpenMPI与Intel编译器的兼容性。
在编写`makefile`时,作者认为这是整个安装过程中最具挑战性的部分,因为网上的各种版本可能造成困惑。`makefile`定义了编译规则和设置,对最终能否成功编译VASP至关重要。作者计划详细解释`makefile`的结构,帮助后来者避免同样的困扰。
总体而言,安装VASP需要熟悉Linux系统管理、编译器的使用以及并行计算环境的配置。这篇文章提供了宝贵的实践经验,对于那些希望在类似环境中搭建VASP计算平台的人来说,是一份非常实用的指南。
2020-03-05 上传
2018-10-11 上传
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