R软件入门指南：从基础到高级应用

"R软件是源自S语言的开源统计分析工具，由新西兰奥克兰大学的统计学家开发。它在Windows、Linux和UNIX等多个操作系统上都能运行，且提供了丰富的程序包，涵盖各种统计学和科学领域的应用。R软件可以通过CRAN进行下载安装，其界面包括控制台、命令行以及各种菜单和快捷按钮。用户需要安装额外的程序包来扩展功能，这些程序包包含了特定的函数、数据、帮助文件等。一些常用的R程序包包括base（基础功能）、stats（统计学）、nlme（混合效应模型）、ape（系统发育与进化分析）等。" R软件是一种强大的统计分析环境，其起源可以追溯到20世纪70年代的S语言，最初由贝尔实验室的开发人员创建。R是由Robert Gentleman和Ross Ihaka在1995年开发的，它以S语言为基础，但作为一个开源项目，其源代码完全公开，对用户免费。这使得R在统计学、社会科学、生物学等领域得到了广泛的应用。 在R中，数据主要以数字、字符、向量、因子、多维数组、矩阵、列表和数据框的形式存在。向量是R中最基本的数据结构，可以包含相同类型的数据，如数值、字符或逻辑值。因子是用于分类数据的特殊向量，而多维数组和矩阵则用于存储数值型数据。列表和数据框可以容纳不同类型的数据，数据框尤其适合处理表格型数据。 R语言的灵活性在于可以编写自定义函数，这使得用户可以根据需求定制分析流程。R的绘图功能强大，能够生成高质量的统计图形。RGui是R的一种图形用户界面，包括菜单栏、快捷按钮、控制台和命令行，方便用户交互操作和输入命令。 为了扩展R的功能，用户需要安装额外的程序包。程序包是一组相关函数、数据和文档的集合，通常针对特定的分析任务。例如，ape程序包用于系统发育和进化分析，vegan用于群落生态学研究。在Windows环境下，这些程序包以zip格式提供，安装后可以直接在R环境中调用其包含的函数。 通过R的CRAN（Comprehensive R Archive Network）网站，用户可以找到数千个不同的程序包，涵盖从基础统计学到复杂建模的各类需求。这些程序包的存在极大地丰富了R的功能，使得R成为了统计分析和数据科学领域不可或缺的工具。