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gaussian09中文版教程
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更新于2023-03-16
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Gaussian 09
使用手册目录
文献引用
准备计算输入档案
o 计算工作类型
o 化学模型
o 基底函数
o 分子系统设定
o 多步骤计算工作
关键词
o 关键词清单
工具程序
参考手册
执行 计算
o 在 计算机系统上执行
o 网络 丛集计算机平行处理:
o 有效使用 程序
o 程序限制
矩阵有关的说明。
模块( )清单
和
的差异
范例计算输入档案和计算输出档案
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
参考文献
1 September
计算输入档案
计算输入档是一个包含一系列的行所构成的 文字文件。
计算输入党的基本结构包含几个段落:
Link
指令:
确定站存盘的位置和名称(段落结束时不需要空行)。
计算路径段落
#
行
:指定所要进行的计算工作类型,模型化学和其它
选项(用空行结束这个段落)。
标题段落:
计算工作的简短描述(用空行结束这个段落)。输入档内要
有这个段落,但 程序不会加以处理。这行数据汇出现在
计算输出档作为识别之用。通常,这一段落会包含化合物名称,对称性,
电子状态,以及其它任何相关的信息。标题段落不能超过五行,必须以
空行终止。在这段落中应避免使用这些符号: control
字母
(
尤其是
Ctrl-G)。
分子系统设定段落:
设定要研究的分子系统(以空行终止这个段落)。
额外的段落选项:
某些计算工作类型需要无外的输入数据(通常以空行
终止段落)。
许多 计算工作输入档只有第二,第三和第四个段落。以下是一
个输入文件的范例,要求对水分子做单一结构能量计算:
!"#
计算路径段落
$%%&'
标题段落
#
分子系统设定
()*!*)#++)
)*!*#)#"+)
)**#)#*")
这计算中,计算路径和标题段落各占一行。分子系统设定段落第零行是分子电
荷和自旋多重态。电荷为零(中性分子),自旋多重态为 #(单一态)。电荷
和自旋多重态行之后是描述分子中各原子位置的行,一个原子一行。这个粒子
中使用直角坐标。分子系统设定在后面会有详细的讨论。
以下这个计算输入文件范例使用 ,指令和一个额外的输入段落:
-.,/.0'Link 0
段落
!"#(/123
计算路径段落
(425
标题段落
#
分子系统设定段落
原子坐标
…
"6
在用来做几何优选的内坐标系统内增加一个键长和一
个键角
#"
这计算工作指定进行几何优选计算。分子系统设定段落后面的输入段或是关键
词 !"#$%&%%需要的输入数据,指定在几何优选计算中使用的
内坐标里增加一个键长和键角。这计算工作同时指定检查档的档名。
为方便查询,以閜表中列出 程序计算输入文件中可能会出现的段
落,依照各段落出现的次序排列。每个段落对应的关键词也列在表中。
计算输入档各段落的次序
段落 需要这输入段落的关键词 是否需要
空行做结
束?
,指令 -指令 否
计算路径段落 '行 所有关键词 是
额外层组 78%
(0%9'
()*)+,
是
标题段落 所有关键词, $-".++/01 除外 是
分子系统设定 所有关键词, $-".++/01 除外 是
原子连接关系 $-"/$1或 #$%/$1 是
冻结原子位置
$-"&%2)3
是
坐标修改
!"#$%&%%
是
第二个标题和分子系统
设定
!"456或 456 两者皆是
第二组坐标的原子连接
关系
$-"/$1或 #$%/$1和
!"456或 456
是
第二组冻结原子
$-"&%2)3
是
第二组坐标修改 !"456或 456 是
第三组标题和分子系统
设定,过渡状态的最初
猜测结构
!"456
两者皆是
第三组坐标的原子连接
关系
$-"/$1或 #$%/$1
!"7#$%&%84569
是
第三组冻结原子
$-"&%2)3
是
第三组坐标修改
!"7#$%&%84569
是
:;<二级结构数据 若分子设定段落中有胺基酸分子团的信息 是
原子质量 &%$$!选项 是
分子力学参数
:)%2)85$;2)85$;+,8
#$%;,
是
感兴趣的振动频率
/:2"&%2)<
是
背景电荷分布
/0)=
是
<(1; ;1:输入 #
或多个段落
.>#和 ?#>需要的输入数
据,&%@+$1,=&%#A@+$1,
选项
是
:1输入数据
5/&2"7()+)$8&%9
是
3表的坐标
&/"&!$)
是
简协限制 %>2?
?2%
$-"&%:)-$1
是
半经验方法参数
格式
!选项=.#"?$0 是
半经验方参数 1(:
格式
#./=?$0选项 是
基底函数设定
8(/8()?
是
基底函数更改
#=
是
有现场系数 @9
?2A?
2+%"&%
是
7:设定
%$"/)%8(/
是
密度释配基底组设定
()>,?
是
:1溶解模型输入
5/&2"&%
是
;B<参数
>26?
是
最初猜测的来源
"!
是
要结合的对称类型
"$B5,--
否
轨域设定分离 C和 D
"/)%
是
轨域更改分离 C和 D
".+)
是
轨域排序分离 C和 D
")-
是
轨域 E<电子对
@?
否
状态平均的权重
/.55/2"5.*)=
否
要计算自旋轨道耦合效
应的状态
/.55/2"5!)C
否
轨域冻结信息 &%A%$B选项 是
要精制的 7:B轨域
(6"&%)C+
是
要计算自旋自旋耦合常
数的原子清单
#&"&%.$-
是
另一种原子半径 $!"&%&%或 &%.&% 是
静电性质的数据 )$!"&%或 ! 是
F<(输入数据
$!"?&%
否
简协正振动模式选择
2)<"5+1$)-+#$%
是
障碍旋转体 %
322% 输入数据
2)<"&%:%)%
是
非简协正则振动模式选
择
2)<"5+1.0)-$1$)-+#$
%
是
B 的正则振动模式
2)<"5+12/:6$)-+#$%
是
非简协性的输入数据
2)<"&%.0)-$1
是
B 输入数据
2)<"&%2/:6
是
:?,输出档名
!"1
否
:3(1输出档名
!"A2
否
输入数据的语法
通常 计算输入数据遵循以下语法规则:
输入的数据没有固定的格式,和字母大小写无关。
空格,跳格(5),逗点,或前斜线可以任何组合方式分隔在一行中
的各项。连续多个空格当做一个区隔。
关键词的选项可用以下方式设定:
o keyword = option
o keywordoption
o keyword/option#=option=G
o keywordoption#=option=G
多重选项要用括号聚集,各选项之间可用有效的符号加以区隔(通常使
用逗点符号)。括号前的等号可以省略,括号之前和之后也可以有空格。
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