NCBI数据库查询指南:从基因到蛋白质的全面探索
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更新于2024-07-23
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"NCBI使用教程"
NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国家生物技术信息中心,创建于1988年,旨在构建一个计算机化的分子生物学、生物化学和遗传学知识储存和分析系统。该中心的主要任务包括开发先进的信息处理方法,促进科研人员和医疗工作者对数据库和软件的利用,以及在全球范围内推动生物技术信息的共享。
NCBI的核心服务之一是Entrez,这是一个综合性的生物信息检索系统。通过Entrez,用户可以访问PubMed,这是一个包含大量医学文献书目信息的数据库,涵盖了4300多种生物医学期刊,回溯至1966年,记录数量超过1100万条。PubMed不仅提供免费的题录和文摘,还支持与原文链接(部分免费),并且有自动检索词匹配功能,使得搜索更加方便快捷。
此外,Entrez还能检索GenBank、EMBL等核酸序列数据库,以及Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等蛋白质序列数据库。它允许用户从核酸序列翻译到蛋白质序列,甚至可以查询蛋白质三维结构数据和大分子模式。对于基因组学研究,Entrez也能提供基因组图谱信息。
在PubMed中,文献被归类为不同的数据类型,包括期刊论文、综述等,并且使用Medical Subject Headings (MeSH) 进行标准化索引。未经过规范处理的数据标记为"In process citation",在获得MeSH词后会被正式纳入MEDLINE。
NCBI的发展历程包括了从INDEX MEDicus到MEDLINE的各种形式,如MEDLARS Online、MEDLINE CD和后来的免费网络版MEDLINE。随着互联网的普及,PubMed成为在线检索MEDLINE的主要平台,同时,还有其他如BioMedNet和Healthgate提供的Medline服务。
NCBI是一个强大的生物信息学资源库,提供多方面的生物医学信息检索服务。无论是在基因组学、蛋白质组学还是医学文献研究中,熟练使用NCBI都能极大地提高研究效率和质量。通过学习和掌握NCBI的使用方法,科研人员和医疗工作者可以更好地发掘和利用全球生物医学领域的海量数据。
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jialovelyjia
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