中国荷斯坦奶牛DBP基因克隆与序列分析
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更新于2024-09-05
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"中国荷斯坦奶牛DBP基因全长cDNA的克隆及序列分析"
这篇论文是中国荷斯坦奶牛DBP基因研究的重要成果,首次报道了该特定奶牛品种DBP基因的全长cDNA序列。DBP基因,即维生素D结合蛋白基因,是编码一种在血液中运输维生素D及其代谢产物的关键蛋白质。在中国荷斯坦奶牛中克隆并分析这个基因,对于理解该基因在奶牛生理过程中的作用,尤其是维生素D代谢和骨骼健康方面,具有重大意义。
研究采用了cDNA末端快速扩增(RACE)技术,这是一种常用的分子生物学方法,用于获取基因的完整开放阅读框(ORF),即编码蛋白质的序列。论文中提到的DBP基因cDNA全长1692bp,编码474个氨基酸,这意味着该基因可能编码一个相对较大的蛋白质。生物信息学分析揭示了该蛋白质的多个特性,包括一个N端信号肽,暗示它可能通过胞吐作用分泌到细胞外,以及一个跨膜区,可能涉及细胞内或细胞间的信号传递。
蛋白质的分子量被计算为14.09206KD,理论等电点为5.42,这决定了它在特定pH条件下的电荷状态。脂肪系数75.93表示该蛋白可能富含疏水氨基酸,而总亲水性为-0.423,暗示在水环境中可能存在一定的亲水性和疏水性平衡。一级结构分析显示丙氨酸是最丰富的氨基酸,同时,蛋白含有6个功能结构域,这些结构域可能对应于不同的生物学功能。
论文还进行了二级结构预测,发现主要由α-螺旋、β-旋转、延伸链和随机螺旋组成,这些是蛋白质三维结构的基础元素。通过同源序列比较,中国荷斯坦奶牛的DBP基因与原牛(即普通牛)的氨基酸相似度高达99%,这反映了两者之间的高度遗传一致性。
系统进化分析表明,中国荷斯坦奶牛与原牛在DBP基因上亲缘关系较近,共享同一进化分支。这一发现不仅有助于理解DBP基因在哺乳动物进化中的位置,也为奶牛遗传学、育种学以及维生素D相关疾病的预防提供了宝贵的资料。
关键词:中国荷斯坦奶牛,维生素D结合蛋白,cDNA末端快速扩增,克隆,序列分析
这项工作为深入理解中国荷斯坦奶牛的DBP基因功能、优化奶牛营养管理和健康状况提供了基础数据,并为未来的遗传改良和疾病预防研究打下了坚实基础。
2021-06-17 上传
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