NCBI教程:探索全球生物技术信息的自动化系统
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更新于2024-07-25
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NCBI (National Center for Biotechnology Information) 是一个由美国国会授权建立的国家级生物技术信息中心,创建于1988年,旨在促进分子生物学、生物化学和遗传学领域知识的计算机化管理和分析。NCBI的主要任务包括开发自动化系统来存储和分析这些领域的数据,支持研究人员和医疗专业人员使用数据库和软件,以及推动全球生物技术信息的共享合作。
NCBI的核心功能是其生物信息整合系统,其中最著名的工具是Entrez。Entrez是NCBI的一个综合搜索平台,提供了一系列关键服务,如PubMed,它是一个广泛用于查找医学文献的数据库,包含超过1100万条记录,自1966年以来的医学、护理、牙科、兽医学等多个学科的文献。PubMed提供免费的题录和摘要,允许用户通过搜索关键词找到相关文献,同时支持检索词自动转换匹配,方便用户操作。用户还可以点击链接访问原文,部分来源可能免费获取。
Entrez还涵盖了GenBank和EMBL等核酸序列数据库,Swiss-Prot、PIR、PRF和PDB等蛋白质序列数据库,以及蛋白质三维结构数据和MMDB等其他生物信息数据库。通过Entrez,研究人员可以方便地从这些数据库中检索和分析生物序列信息,进一步探索基因组数据和结构信息。
历史方面,NCBI的检索服务经历了几个发展阶段,从最早的INDEXMEDUS到MEDLINE、MEDLARSONLINE、MEDLINECD,再到现在的MEDLINEWeb和PubMed。MEDLINEWeb作为免费资源,提供了PubMed和BioMedNet Evaluated Medline等几种不同的检索途径。PubMed是其中最受欢迎的选择,不仅免费提供题录和摘要,还具备与原文链接、检索词匹配优化和用户友好的界面等特点。
此外,NCBI的数据库收录了来自全球70多个国家和地区的4300多种生物医学期刊,这些文献经过严格的筛选和处理,包括MEDLINE、In-Process Citation和获MeSH词后加入MEDLINE的记录。对于最新或尚未规范化处理的数据,也会有[inprocess]的标记提醒用户。
NCBI是生物医学研究的重要资源库,它的存在极大地便利了科学家们查找、整合和分析相关信息,推动了生命科学领域的进步。
2021-09-30 上传
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