Lammps并行安装教程：详细步骤与环境配置

本篇文章是关于Lammps（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）的安装教程，由作者zhjs编写，适合对Lammps感兴趣且希望在Linux环境下进行并行计算的用户。文章详细介绍了如何在特定目录结构（如/home/software和/home/vm）下安装多个必要的软件包，包括Lammps本身、MPICH（Message Passing Interface for Clusters of Workstations）以及JPEG和FFTW（Fastest Fourier Transform in the West）库。 首先，作者强调了在root权限下安装FFTW3的重要性，通过`./configure`命令指定安装路径，并使用`make`和`makeinstall`进行编译和安装。接着，作者指导读者分别安装MPICH3，同样通过配置、编译和安装步骤来完成。 安装JPEG库时，也采用类似的流程，先配置然后构建和安装。在安装过程中，文章提到了设置环境变量的步骤，通过编辑`.bashrc`文件，添加mpich、fftw和jpeg的bin路径以及lib路径，确保系统可以识别这些库的执行和链接。 此外，教程还涉及到了MPICH的特殊配置，比如检查计算机的IP地址并将其添加到`/etc/hosts`文件中，这对于网络通信和并行计算的正确配置至关重要。最后，创建了一个名为`mpd.conf`的文件，虽然内容未在提供的部分给出，但通常在MPICH配置中，此文件可能用于配置MPICH守护进程（mpd）以支持分布式计算。 这篇教程提供了一个清晰的指导，帮助用户在Linux环境中安装和配置Lammps及其依赖库，以实现高效的原子或分子模拟并行计算。对于想要利用Lammps进行科研或工程项目的人员，这是一个宝贵的资源。