PHP+MySQL实现在线比较基因组学测试实例
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更新于2024-08-08
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比较基因组学是生物信息学的一个关键分支,它起源于人类和其他生物大规模基因组测序项目的推进。这个领域的研究主要依赖于遗传学的异同比较方法,但区别于传统的比较解剖学和组织学,它在基因组层面进行深度分析,比如基因组大小、基因数量、基因位置、排列顺序以及核苷酸序列的全基因组比较。通过各国的基因组计划,例如人类基因组计划和美国的食物基因组计划,已经对多种模式生物,如大肠杆菌、酵母、果蝇、线虫、小鼠、鱼类和植物如拟南芥、小麦等进行了测序。
在教学资源方面,生物信息学札记(第三版)是由樊龙江教授编写的,他是浙江大学作物科学研究所、生物信息学研究所、IBM生物计算实验室和沃森基因组科学研究院的研究人员。该札记起初是作者为教授《生物信息学》课程准备的备课笔记,主要基于翻译和编辑的外文资料。由于学生们对于中文教材的需求,札记被整理并在网上发布,供广大读者参考。然而,作者强调这是一份基础性的资源,可能存在错误和偏颇,鼓励读者自我批判。
在版本更新中,特别提到了2001年以后生物信息学的快速发展,特别是高通量测序技术的兴起,带动了小RNA分析和大规模群体单核苷酸多态性(SNP)数据的处理。作者在第三版中新增了第七章关于小RNA分析和第八章关于遗传多态性和正向选择检测的内容,这些章节由其博士生王煜主导编写,其他学生如李泽峰和刘云协助整理文献。
此外,札记还包含了一章至八章的详细内容,涵盖了生物信息学的多个核心主题,如通论、分子数据库、序列分析、基因组测序、分子进化、蛋白质结构预测以及小RNA和遗传多态性分析。附录部分则提供了生物信息学的主要英文术语及其中文解释,以及核苷酸和氨基酸代码等基础知识。
比较基因组学作为生物信息学的一个重要应用,利用现代技术手段研究不同生物之间的基因组差异,对于理解生物进化、遗传疾病机制以及作物改良等领域具有深远影响。随着技术的持续进步,这个领域的研究将更加深入且多元化。
2020-08-05 上传
2021-02-25 上传
2021-09-30 上传
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