R语言聚类分析实战:k-means与K-medoids算法解析
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更新于2024-07-19
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"这篇资源主要介绍了如何使用R语言进行聚类分析,涵盖了k-means聚类、K-medoids聚类以及层次聚类和基于密度的DBSCAN算法。通过实例展示了如何利用R语言的内置数据集IRIS进行k-means聚类,并解释了聚类分析的基本概念、目的和应用领域。此外,还提到了几种常用的距离度量方法,如欧式距离、曼哈顿距离和余弦相似度。"
聚类分析是一种无监督学习方法,旨在将数据集中的对象自动分组到不同的簇中,使得同一簇内的对象相似度较高,而不同簇之间的对象相似度较低。这种方法广泛应用于商务智能、图像识别、搜索引擎优化、生物信息学和安全性等领域,帮助我们发现数据的内在结构和模式。
在R语言中,有多种聚类算法可供选择。例如,k-means聚类是最常用的聚类方法之一,它通过迭代寻找簇中心(即形心)并重新分配对象来最小化簇内的平方误差和。R语言实现k-means算法通常使用`kmeans()`函数,如示例所示,对IRIS数据集进行聚类分析,将物种信息忽略后,将数据点分为3个簇。通过`plot()`函数可视化聚类结果,可以看到不同颜色代表的簇。
K-medoids聚类,也称为PAM(Partitioning Around Medoids,围绕原型的划分),是一种更健壮的聚类方法,因为它使用实际的数据点作为簇的代表,而不是像k-means那样使用均值。在R中,可以通过`fpc`包的`pam()`函数实现K-medoids聚类。相比k-means,K-medoids对于异常值和非球形分布的数据更鲁棒。
除了划分方法,还有层次聚类,它通过构建对象之间的树状结构(谱系图或 dendrogram)来形成簇。层次聚类分为凝聚型(agglomerative)和分裂型(divisive),在R中可以使用`hclust()`函数进行实现。
最后,基于密度的聚类方法,如DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise),能够发现任意形状的簇,并且对噪声数据不敏感。在R中,可以使用`dbscan()`函数来自`dbscan`包实现这种聚类。
在进行聚类分析时,选择合适的距离度量方法至关重要。欧式距离是最常用的距离度量,适用于大多数情况;曼哈顿距离则考虑了每个维度上的绝对差异;余弦相似度则关注向量的方向而非长度,适用于特征向量之间的角度比较。
总结来说,R语言提供了丰富的聚类工具和数据处理库,使得数据分析师和研究人员能够方便地探索数据的聚类结构,从而获取有价值的洞察。了解并熟练掌握这些方法,将有助于在各种实际问题中找到隐藏的模式和群体。
2019-02-16 上传
2020-05-09 上传
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