毛白杨LabA-Likel基因克隆、表达特性与组织差异
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更新于2024-08-11
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"毛白杨LabA-Likel基因的克隆与表达特性及其表达载体的构建 (2011年)"
本文主要介绍了对毛白杨(Populus tomentosa) LabA-Likel基因的研究,该研究涉及基因的克隆、结构分析、家族成员鉴定以及表达特性的探索。研究人员运用了滤纸吸附噬菌体-聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)技术,从毛白杨花芽的cDNA文库中成功分离并克隆了PtlabA-likel基因的全长cDNA序列。
在Conserved Domains Database (CDD) 中,对克隆得到的基因进行氨基酸保守结构域分析,发现该基因包含一个LabA-like超家族结构域。基于这一发现,研究人员将此基因命名为PtlabA-likel。通过BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)分析,他们在毛果杨基因组数据库中找到了9个具有相同保守结构域的家族成员,这些成员可能与PtlabA-likel基因有类似的生物学功能。
为了理解这个基因家族的系统发育关系,研究者使用BioEdit和MEGA3.1软件构建了基因家族表达蛋白的系统进化树。这有助于揭示基因间的进化关系和可能的共同起源。
此外,通过逆转录PCR(RT-PCR)方法,研究了PtlabA-likel基因及其家族成员在毛白杨不同组织中的表达模式。结果表明,PtlabA-likel基因和PtlabA-like6在茎、幼叶、成熟叶和雌雄花芽组织中都有表达,但PtlabA-likel的表达丰度相对较高。另一方面,PtlabA-like8仅在根部有较低的表达。其余家族成员则在根、茎、成熟叶、幼叶和雌雄花芽组织中均检测到表达,但各成员的表达丰度存在差异。
最后,为了进一步探究PtlabA-likel基因的功能,研究者构建了该基因的正义表达载体。这种表达载体的构建为后续的基因功能验证实验提供了基础,如过表达或敲除实验,以深入理解该基因在植物生长发育和生理过程中的作用。
关键词:毛白杨;LabA-like;克隆;表达
中图分类号:S718.46
文献标志码:A
文章编号:1000-1522(2011)04-0055-08
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