Fx Agnes集群聚合分析的R语言应用
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更新于2024-12-09
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资源摘要信息:"Cluster_Aglomerativo:Fx Agnes集群"
在数据科学和机器学习领域,聚类是一种重要的无监督学习方法,用于将数据集中的样本根据相似性分组成多个簇。聚类算法有很多种,其中包括层次聚类算法。层次聚类算法可以进一步分为凝聚(自底向上)和分裂(自顶向下)两种方法。本文档标题“Cluster_Aglomerativo:Fx Agnes集群”中提到的“Agglomerative”一词指的是凝聚层次聚类算法,而“Fx”可能是指某特定的实现或者是用以区分不同变体的标识符。
在R语言中,层次聚类是一种常用的聚类技术,它通过构建一个多层次的嵌套簇结构,允许用户对数据集进行从最细粒度到最粗粒度的不同层次的分析。R语言提供了多种层次聚类的实现,其中Agglomerative Nesting(AgNES)算法是其中之一。
Agglomerative Nesting(AgNES)算法是一种基于距离度量的聚类方法,它从单个样本点开始,将样本点按最小的距离合并,形成簇,然后逐步迭代,根据一定的合并策略将小簇合并为更大的簇,直到达到预定的簇数量或者满足停止条件。
在R中实现AgNES算法可以使用诸如`agnes`函数,它是`cluster`包中的一个函数。该函数可以执行凝聚层次聚类,并提供了不同的方法来计算簇间距离。`agnes`函数的基本用法如下:
```r
agnes(x, diss = inherits(x, "dist"), method = c("average", "single", "complete", "ward"), stand = FALSE, …)
```
其中`x`是数据矩阵或距离对象,`method`参数指定簇间距离的计算方法,包括:
- `average`:平均链锁距离,簇内所有点对距离的平均值。
- `single`:单链锁距离,簇内最小距离。
- `complete`:完全链锁距离,簇内最大距离。
- `ward`:Ward方法,一种方差最小化方法,通常用于生成紧凑的簇。
在实际应用中,Agglomerative Nesting算法非常适用于发现数据中隐含的分层结构,它可以揭示数据中的聚类趋势和不同层次的结构关系。因此,该算法在生物学、市场细分、社会网络分析等多个领域都有广泛的应用。
在使用层次聚类进行数据分析时,经常需要对结果进行可视化,以便更好地理解数据中簇的结构。在R中,可以通过`plot`函数或`agnes`函数配合`pltree`函数生成树状图(Dendrogram),这种图可以清晰地展示数据点如何根据相似性逐步合并成簇的过程。
值得注意的是,层次聚类方法在处理大型数据集时可能会非常慢,因为每次合并簇的操作都需要计算新形成的簇内所有点对的距离。而且,最终的聚类结果也可能会受到数据中异常值的影响。因此,对于大型数据集或者对聚类速度有要求的场景,人们可能会考虑使用基于距离的快速聚类算法,如K-means聚类。
最后,本文件的“压缩包子文件的文件名称列表”中的“Cluster_Aglomerativo-main”可能指向的是一个包含层次聚类相关代码、数据集以及可能的分析报告的项目或模块。该压缩包可能包含R脚本、数据文件以及可能的文档说明,用于演示如何在R语言中使用层次聚类技术进行数据分析。
2021-02-08 上传
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