MATLAB实现PCA主成分分析算法源码教程

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1 下载量 62 浏览量 更新于2024-10-29 收藏 10KB ZIP 举报
PCA,即主成分分析(Principal Component Analysis),是一种常用的数据降维和特征提取技术,广泛应用于图像处理、模式识别、机器学习等多个领域。PCA的目标是通过线性变换将原始数据转换成一组各维度线性无关的表示,同时保留对数据的尽可能多的变异信息。这一过程能够简化数据集,去除噪声和冗余,使得数据更容易理解和处理。 在本资源中,我们有标题为"PCA.zip_PCA matlaba_PCA matlab_PCA主成分_PCA主成分分析_matlab PCA"的压缩文件,其中包含了一个描述为"PCA主成分分析算法matlab源码,利用matlab实现PCA算法。"的文档,以及一个标签为"pca__matlab pca_matlab pca主成分 pca主成分分析 matlab_pca"的标记。资源的文件名列表中仅提及一个名为"PCA.docx"的文件。 从标题中可以提取以下关键知识点: 1. 主成分分析(PCA):是一种统计方法,通过正交变换将可能相关的变量转换成一组线性不相关的变量,称为主成分。主成分按照方差递减的顺序排列,可以用来压缩数据和去除噪声。 2. 实现PCA算法:在资源中包含了一段用Matlab编写的源码,这些代码可以用来执行PCA算法。Matlab是一种高性能的数值计算和可视化软件,非常适合于矩阵运算、算法开发和数据分析。 3. 数据降维:PCA是降维技术的一种,它可以将多维数据降维到少数几个主成分上,从而简化数据集,使得数据分析和可视化成为可能。 4. 特征提取:PCA通过选取方差最大的主成分作为新的特征,这些特征能够代表原始数据的大部分信息。 5. Matlab实现:Matlab环境下的PCA实现通常使用内置函数或手动编写算法来执行。Matlab提供了一些内置函数,如`pca`函数,可以非常方便地实现PCA算法。 从描述中可以明确的了解到,该资源提供了一个用Matlab编写的PCA算法源码。这意味着用户可以使用这个源码直接在Matlab环境中执行PCA分析,不需要从头开始编写代码。这对于那些不熟悉PCA数学原理或Matlab编程的用户来说,是非常有帮助的。用户只需要将源码下载解压,然后运行Matlab并调用相应的脚本或函数即可开始进行PCA分析。 标签中包含了多个以"pca"和"matlab"为关键词的词组,这些词组明确了资源的主题和使用场景。关键词"pca__matlab"表明资源与Matlab编程语言紧密相关,而"pca主成分"和"pca主成分分析"则是PCA的核心概念。"matlab_pca"则是表明资源是专门为Matlab环境编写的PCA算法。 最后,文件列表中提到了一个名为"PCA.docx"的文件。虽然文件列表中仅列出了一个文件名,但可以推测这个文件很可能包含有关PCA算法和Matlab实现的详细文档或使用说明。文档可能会介绍PCA算法的工作原理、Matlab代码的结构、如何运行代码以及如何解读结果等。 总而言之,这个压缩文件提供了一套完整的PCA算法实现方案,其中包括Matlab代码以及可能的使用文档,对于需要进行数据降维、特征提取的用户来说,是一个宝贵的资源。

import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn import datasets from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import StandardScaler data=pd.read_csv('H:/analysis_results/mean_HN.csv') data.head() x=data.iloc[:,1:7] y=data.iloc[:,6] scaler=StandardScaler() scaler.fit(x) x_scaler=scaler.transform(x) print(x_scaler.shape) pca=PCA(n_components=3) x_pca=pca.fit_transform(x_scaler) print(x_pca.shape) #查看各个主成分对应的方差大小和占全部方差的比例 #可以看到前2个主成分已经解释了样本分布的90%的差异了 print('explained_variance_:',pca.explained_variance_) print('explained_variance_ratio_:',pca.explained_variance_ratio_) print('total explained variance ratio of first 6 principal components:',sum(pca.explained_variance_ratio_)) #将分析的结果保存成字典 result={ 'explained_variance_:',pca.explained_variance_, 'explained_variance_ratio_:',pca.explained_variance_ratio_, 'total explained variance ratio:',np.sum(pca.explained_variance_ratio_)} df=pd.DataFrame.from_dict(result,orient='index',columns=['value']) df.to_csv('H:/analysis_results/Cluster analysis/pca_explained_variance_HN.csv') #可视化各个主成分贡献的方差 #fig1=plt.figure(figsize=(10,10)) #plt.rcParams['figure.dpi'] = 300#设置像素参数值 plt.rcParams['path.simplify'] = False#禁用抗锯齿效果 plt.figure() plt.plot(np.arange(1,4),pca.explained_variance_,color='blue', linestyle='-',linewidth=2) plt.xticks(np.arange(1, 4, 1))#修改X轴间隔为1 plt.title('PCA_plot_HN') plt.xlabel('components_n',fontsize=16) plt.ylabel('explained_variance_',fontsize=16) #plt.savefig('H:/analysis_results/Cluster analysis/pca_explained_variance_HN.png') plt.show()报错'numpy.float64' object is not iterable,如何修改

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