使用Matlab提取PerceptPC神经刺激器数据的PerceptToolbox
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更新于2024-11-05
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本资源提供了一套基于MATLAB的工具箱(Toolbox),旨在帮助研究者和开发者从Medtronic Percept PC神经刺激器中提取存储为JSON格式的数据。通过使用该工具箱中的loadJSON脚本,可以方便地从Medtronic Percept PC的多种记录模式中提取数据,这些模式包括设置(setup)、流式传输(streaming)、测量(measuring)、不确定性流式传输(uncertain streaming)以及时间轴(timeline)。
在开始使用之前,用户需要编辑loadJSON脚本中的路径信息,以确保脚本能够正确地定位到包含JSON文件的文件夹。此外,工具箱还提供了处理LFP(Local Field Potential,局部场电位)数据的函数,允许用户对这些数据进行深入分析。
1. 数据提取与路径设置:
- loadJSON脚本支持从Medtronic Percept PC的记录模式中提取数据。
- 用户需要事先设置正确的文件路径,以便于loadJSON能够找到并加载JSON文件。
2. 数据同步与校正:
- 如果需要将LFP数据与其他生物信号数据(如EMG或EEG记录)进行同步,可以通过设置correct4missingSamples参数为“true”来进行必要的样本校正。
3. 数据分析与可视化:
- 工具箱提供了plotChannels函数,用于为每个通道绘制原始信号。
- plotSpectrogram函数允许用户为每个通道绘制频谱图。
- plotPwelch函数用于绘制每个通道的功率谱密度图(Power Spectral Density, PSD)。
4. 流媒体数据恢复:
- 如果流媒体数据因设备故障(如平板电脑上的加载屏幕)而遭到破坏,concatenateLFP脚本可以帮助用户将两个记录(之前和之后的)破坏部分串联起来,以尽可能地恢复完整的数据记录。
5. 开源与贡献:
- 本工具箱是由Yohann Thenaisie开发的开源项目,目前与洛桑大学医院及里德大学医学院中心合作开发。
6. 工具箱文件结构:
- 压缩包子文件PerceptToolbox-main包含了上述所有脚本和相关文件,供用户下载使用。
在使用该工具箱时,用户应当具备MATLAB编程基础,并熟悉JSON数据格式。此外,该工具箱适用于需要对局部场电位数据进行分析和处理的研究人员,特别是在神经科学研究、生物医学工程等领域。通过本工具箱,用户能够更高效地处理和分析从神经刺激器中提取的复杂数据,进一步推进临床研究和实验分析工作。由于该工具箱是开源的,用户也可以根据自己的需求对工具箱进行修改和扩展,以适应更多样化的应用场景。
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