PHP+MySQL实现：蛋白质序列数据库在线测试与结构分析

本文档主要介绍了生物信息学中的一个重要方面——蛋白质序列数据库和结构数据库。首先，作者列举了几个主要的蛋白质序列数据库，如SWISS-PROT、TREMBL和PIR，这些数据库是研究者获取蛋白质序列信息的重要资源，它们存储了大量的已知蛋白质序列。SWISS-PROT以其高质量的注释闻名，而TREMBL则提供更大的数据集，包括未经过严格注释的序列。 其次，文本提到了蛋白质结构数据库PDB，它是国际上最大的蛋白质三维结构数据库，包含了通过X射线晶体学和核磁共振技术解析的结构信息。NRL-3D数据库提供了PDB中的蛋白质序列，便于进行结构与序列的比较。HSSP数据库则基于多序列同源性比较，为SWISS-PROT中的蛋白质序列提供了可能的三维结构信息，这对于理解蛋白质结构和功能关系至关重要。 在学习生物信息学的过程中，理解这些数据库的使用和分析方法对于基因组学、生物统计学以及蛋白质结构与功能预测等领域的工作至关重要。此外，文档还提到了生物信息学教材《生物信息学札记》的作者及其修订背景，强调了随着高通量测序技术的发展，教材内容也在不断更新，如增加了小RNA分析和遗传多态性检测等内容，反映出生物信息学研究的快速进步。 这篇文档是生物信息学教材的一部分，涵盖了从数据库查询到结构与功能分析的关键知识点，为学习者提供了在该领域进行研究和实践的实用指南。