Python实现PCA概念提取及数据树结构化存储

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0 下载量 140 浏览量 更新于2024-10-28 收藏 3KB ZIP 举报
资源摘要信息:"《test_pca.zip_python 数据结构》是一个关于Python数据结构应用的压缩包文件,它包含了两个主要文件:2-1.csv和test_pca.py。文件的标题强调了内容的两个关键词:'PCA'(主成分分析,一种常用的数据降维技术)和'数据结构'。在描述中提到,该文件包主要关注于如何使用Python语言实现概念的提取,并且最终目的是把数据存成树的结构。标签'python_数据结构'进一步明确指出该资源主要关注Python语言下的数据结构实现。" 1. Python数据结构概念和应用: - Python作为高级编程语言,在处理数据结构方面拥有强大的内置数据结构,如列表(lists)、元组(tuples)、字典(dictionaries)和集合(sets)等。 - 除了内置数据结构外,Python也支持通过面向对象编程创建自定义数据结构。 - 在数据处理和分析中,数据结构的选择会影响程序的性能和效率。合理使用数据结构可以提高代码的可读性、可维护性以及运行速度。 2. PCA(主成分分析)概念和实现: - PCA是一种统计方法,通过正交变换将可能相关的变量转换为一系列线性不相关的变量,这些变量称为主成分。 - PCA广泛用于数据降维,通过减少数据集中变量的数量来简化数据集,同时保留大部分的原始变量信息。 - 在Python中,PCA可以通过各种数据科学库实现,如NumPy、SciPy或scikit-learn等。 - 根据文件描述,test_pca.py文件可能是用Python实现PCA的一个具体示例。 3. 数据存储结构——树结构: - 树结构是数据结构中的一种,它是一种非线性结构,具有分支特性,数据元素之间存在一对多的层次关系。 - 常见的树结构包括二叉树、B树、红黑树、堆等。 - 树结构在数据库索引、文件系统、人工智能算法等领域中有着广泛的应用。 - 根据描述,“把数据存成树的结构”可能意味着在数据处理过程中,需要通过某种方法将数据转换或组织成树形结构,这可以用于优化数据的存储和检索效率。 4. CSV文件和数据处理: - CSV(逗号分隔值)是一种常用的文本格式文件,用于存储表格数据,包括数字和文本,每行记录一个数据项,字段间以逗号分隔。 - 在Python中,可以使用csv模块来读取和写入CSV文件,也可以使用pandas库更为方便地进行数据的导入导出以及分析操作。 - 2-1.csv文件可能是用于PCA分析的原始数据集,其中包含了用于提取主成分的数据点。 5. test_pca.py文件分析: - 此文件很可能包含使用PCA分析从CSV文件中提取主成分的Python代码。 - 代码可能涉及读取CSV文件、标准化数据、计算协方差矩阵、求解特征值和特征向量、最终投影数据到新的特征空间并存储结果等步骤。 - 该文件也可能包含将PCA后的数据转换成树形结构的代码,例如使用层次聚类算法。 总结以上信息,该资源包重点在于展示如何用Python进行数据结构的操作,特别是PCA的数据降维技术,并探索如何将处理后的数据以树状结构的形式存储。在Python数据结构的应用中,这可能涉及到了数据处理、文件操作、以及机器学习算法的具体实现。对于希望在数据科学或数据分析领域深入学习Python应用的用户来说,这个资源包是十分宝贵的实践材料。

把这段代码的PCA换成LDA:LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=1) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

2023-07-22 上传

优化这段代码 for j in n_components: estimator = PCA(n_components=j,random_state=42) pca_X_train = estimator.fit_transform(X_standard) pca_X_test = estimator.transform(X_standard_test) cvx = StratifiedKFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cost = [-5, -3, -1, 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15] gam = [3, 1, -1, -3, -5, -7, -9, -11, -13, -15] parameters =[{'kernel': ['rbf'], 'C': [2x for x in cost],'gamma':[2x for x in gam]}] svc_grid_search=GridSearchCV(estimator=SVC(random_state=42), param_grid=parameters,cv=cvx,scoring=scoring,verbose=0) svc_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) param_grid = {'penalty':['l1', 'l2'], "C":[0.00001,0.0001,0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100, 1000], "solver":["newton-cg", "lbfgs","liblinear","sag","saga"] # "algorithm":['auto', 'ball_tree', 'kd_tree', 'brute'] } LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=0) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) var = Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

2023-07-14 上传
2023-05-10 上传