全球原核生物基因组测序现状:38.1%的细胞已知基因组信息

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"这篇科研文章由张正和王家宁共同撰写,发表在Microbiome期刊上,探讨了全球原核生物基因组测序的现状。文章通过深度分析地球微生物组计划的数据和公共数据库中的基因组信息,评估了已测序的原核生物比例。" 在当前的生物学研究中,基因组测序技术已经成为揭示微生物进化和功能多样性的重要工具。它极大地推动了我们对微生物如何与其它微生物、宿主及环境相互作用的认知。然而,尽管这项技术发展迅速,但关于地球上已测序的原核生物——包括细菌和古菌——所占的比例,科研界尚未有一个清晰的认识。 张正和王家宁的研究首次尝试解决这一问题。他们利用大数据方法对比了地球微生物组计划的数据与公共数据库中的原核生物基因组信息。结果显示,已知基因组信息的原核生物细胞或类群在地球主要微生物群落中的中位数比例达到了38.1%(16.4%-86.3%),而类群层面这一比例则为18.8%(9.1%-52.6%)。这表明,尽管我们已经取得了一定的进展,但仍有相当一部分原核生物的基因组未被测序。 此外,研究还发现原核生物群落的基因组测序比例与其α多样性显著负相关。这意味着群落内的物种多样性越高,已测序的基因组比例相对越低,揭示了微生物多样性的复杂性和测序工作的挑战性。这项工作不仅提供了对全球原核生物基因组测序现状的估计,也为未来微生物研究的方向和策略提供了重要的参考。 研究团队来自山东大学微生物技术国家重点实验室和苏州研究院,由李越中和张正担任通讯作者。他们的工作对于理解微生物世界的全貌,以及如何更有效地推进微生物基因组学的研究具有深远影响。 原始文章链接和视频摘要提供了进一步的信息,读者可以通过这些链接获取详细的研究结果和作者的讨论。这篇高影响力的文章(IF11.607)强调了微生物基因组研究的重要性,也提醒科研人员在面对微生物多样性的广阔领域时,还有大量的工作需要去做。