没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
首页猪传染性胃肠炎病毒纤突蛋白基因克隆与序列深度解析
该论文详细介绍了猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible Gastroenteritis Virus of Swine,TGEV)TSX毒株的纤突蛋白(Spike Protein,S)基因的克隆与序列分析过程。作者通过RT-PCR和重组PCR技术扩增了该病毒的S基因全长cDNA序列,其长度达到4350bp,已登录于GenBank,编号为DQ001167。这个基因编码的氨基酸总数为1449个,其中N端的前16个氨基酸被认为是推测的信号肽序列,其余的1433个氨基酸则构成成熟蛋白。 通过与GenBank中已发表的9个TGEV毒株的S基因进行对比,研究发现这些序列在核苷酸层面具有高达95%~98%的同源性,推导出的氨基酸序列同源性也相近。这表明TSX株与Miller、T014、TS和HN2002等毒株之间有密切的亲缘关系。 值得注意的是,尽管存在10处碱基突变导致氨基酸的改变,但关键的抗原部位并未发生变异。这对于理解TGEV的进化以及开发针对该病毒的基因疫苗具有重要意义,因为即使基因有变异,抗原决定簇的稳定性可能保持不变,使得疫苗设计更加精确。 这篇论文不仅提供了TGEV S基因的分子生物学数据,也为后续的病毒研究、疫苗设计以及防控策略提供了有价值的基础信息。关键词包括猪传染性胃肠炎冠状病毒、纤突蛋白基因、克隆、序列分析,论文被归类在中图分类号S858.282.65+9.6,表明其属于病毒学和兽医学的研究范畴。文章编号1671-9387(2007)07-0001-06,强调了其在2007年7月的西北农林科技大学学报自然科学版上发表。
资源详情
资源推荐
第
35
卷第
7
期
2007
年
7
月
西北农林科技大学学报(自然科学版)
Journal
of
Northwest A & F University(Nat.
Sci.
Ed.)
猪传染性胃肠炎病毒纤突蛋白全基因
的克隆与序列分析
彭树英1,
2
吕
宁何晓宁张涌
l
(1两北农林科技大学生物工程研究所,陕商杨凌
712100;
2
淮北煤炭师范学院,安徽淮北
235000)
Vo
l.
35
No.7
J u
l.
2007
[摘
要]
采用
RT-PCR
和重组
PCR
扩增猪传染性胃肠炎病毒
(Transmissible
gastroenteritis virus
of
swine ,
TGEV
)T
SX
毒株纤突蛋白
(spike
protein
.S)
基因全长
cDNA
序列,分离纯化
PCR
产物,连接到
pGEM-T
载体,转化
大肠杆菌
DH5a
,筛选阳性克隆
pGEM-S
,并对其进行酶切鉴定和测序,对测序结果及推导氨基酸序列进行同源性分
析。结果表明
.S
基因全长为
4
350
bp(
GenBank
登录号
DQOO
1l
6
7)
,编码
1
449
个氨基酸,
N
端前
16
个氨基酸为推测
的信号肤序列,其后
1
433
个氨基酸构成成熟蛋白;与
GenBank
中已发表的
9
个
TGEV
毒株
S
基因进行比较,核背酸
序列同源性为
95%~98%
,推导的氨基酸序列同源性为
95%~98%
。基于
S
基因及其推导氨基酸序列的聚类分析表
明
.TSX
株与
Miller
、
T014
、
TS
和
HN2002
株亲缘关系较近。
S
基因变异是由于碱基突变造成
10
处氨基酸发生改变,
但主要抗原部位未发生任何变异,为进一步研制猪传染性胃肠炎基因疫茵提供了良好的候选基因。
[关键词]
猪传染性胃肠炎冠状病毒;纤突蛋白基因;克隆;序列分析
[中图分类号]
S858.282.65+9.6
[文献标识码]
A
[文章编号]
1671-9387(2007)07-0001-06
Cloning
and
sequence analysis
of
spike protein gene
of
swine
transmissible gastroenteritis coronavirus
PENG
Shu-yi
ng
1.
2
,
LU
Ning
1
,
HE
Xiao-ning
1
,
ZHANG
Yong
1
(1
lnstitute
01
Bio-engineering.
Northwest
A & F
Univérsity
•
Yangling
,
Shaanxi
712100
,
China;
2
Huaih
凹
Coal
lndustry
Teachers
College
,
Huaib
凹
,
Anhui
235000 ,
China
)
Abstract:
The
spike
(S)
glycoprotein
of
transmissible
gastroenteritis
virus
(TGEV)
is
the
predomi
nant
inducer
of
neutralizing
antibodies.
S
gene
of
TGEV
TSX
strain
was
amplified
by
RT-PCR
and
recom
binant
PC
R.
The
amplified
DNA
fragments
were
separated
and
recovered
from
agrose
ge
l,
subsequently
li-
gated
into
pGEM-
T
vector
,
and
then
transformed
into
E.
coli
DH5α.
The
positive
clones
named
pGEM-S
were
screened
and
identified
by
restrict
endonuclease
digestion
and
then
sequenced.
The
whole
length
of
S
gene of field
TGEV
strain
was
4 350
bp
,
which
encoded
1 449
amino
acids.
The
initiative
16
amino
acids
were signal
peptide.
The
homologies
of
nucleic
acid
and
amino
acid
of
spike
among
strains
of
TGEV
were
95
% - 98 %
and
95 % - 98 % ,
respectively.
Phylogenetic
tree
based
on
S
gene
and
deduced
amino
acid
se-
quence
of
10
different
strains
of
TGEV
showed
that
field
TGEV
had
closer
relationships
with
strain
Mill-
er,
TO
14 ,
TS
,
and
HN2002.
Moreover
,
there
were
some
differences
in
the
antigenic
site
between
TSX
and
other
strains
of
TGEV
,
but
the
main
antigenic
site
didn'
t
change.
Therefore
,
the
study
provides
a
good
can-
f
收稿日期]
2006-06-07
[基金项目]
国家
"863"
高技术研究与发展计划项目
(No.2004AA213072)
[作者简介]
彭树英
0977-)
,女.内蒙古通辽市人,在读博士,主要从事转基因技术研究。
E-mail:pengshuying77@yahoo.com.
cn
o
[通讯作者]
张
涌
0956
一九男,内蒙古呼和浩特市人,教授,博士生导师,主要从事发育生物学与胚胎工程研究。
E-mail:zhangyl@public.xa.sn.
cno
下载后可阅读完整内容,剩余5页未读,立即下载
weixin_38717143
- 粉丝: 3
- 资源: 946
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- 十种常见电感线圈电感量计算公式详解
- 军用车辆:CAN总线的集成与优势
- CAN总线在汽车智能换档系统中的作用与实现
- CAN总线数据超载问题及解决策略
- 汽车车身系统CAN总线设计与应用
- SAP企业需求深度剖析:财务会计与供应链的关键流程与改进策略
- CAN总线在发动机电控系统中的通信设计实践
- Spring与iBATIS整合:快速开发与比较分析
- CAN总线驱动的整车管理系统硬件设计详解
- CAN总线通讯智能节点设计与实现
- DSP实现电动汽车CAN总线通讯技术
- CAN协议网关设计:自动位速率检测与互连
- Xcode免证书调试iPad程序开发指南
- 分布式数据库查询优化算法探讨
- Win7安装VC++6.0完全指南:解决兼容性与Office冲突
- MFC实现学生信息管理系统:登录与数据库操作
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功