在基因工程中，酶的作用至关重要。其中一类被称为限制性核酸内切酶（restriction endonuclease），也被简称为限制性内切酶或限制酶。这些酶能够识别双链DNA分子中的特定核苷酸序列，并通过切割DNA的双链结构来发挥作用。
限制性酶的发现与寄主控制的限制与修饰现象（R/M体系）有关。研究人员发现，侵染大肠杆菌的噬菌体存在一些功能性障碍，即寄主控制的限制与修饰现象。这类现象类似于免疫系统，细菌的R/M体系能够辨别自身的DNA与外来的DNA，并能够降解后者。
以大肠杆菌为例，它含有EcoB核酸酶和EcoB甲基化酶。当λ(k)噬菌体侵染大肠杆菌时，由于其DNA中含有EcoB核酸酶特异识别的碱基序列，这些DNA会被降解掉。然而，大肠杆菌的DNA中也存在这种特异序列，但可在EcoB甲基化酶的作用下，通过催化S-腺苷甲硫氨酸（SAM）将甲基转移给限制酶识别序列的特定碱基，使其甲基化。
除了限制性核酸内切酶之外，还有其他重要的酶在基因工程中发挥作用。例如，DNA连接酶负责连接两个DNA分子的末端，使其形成连续的DNA链。DNA聚合酶则在DNA复制过程中起着关键作用，通过将新的核苷酸加入到DNA链上来合成新的DNA分子。
酶在基因工程中的应用非常广泛。通过使用限制性核酸内切酶，可以选择性地切割DNA链，从而实现特定基因的分离和提取。然后，利用DNA连接酶将目标基因与载体DNA连接起来，形成重组DNA。最后，通过DNA聚合酶的作用，可以在体外合成大量的目标DNA。
基因工程的酶学基础为我们提供了强大的工具和技术，使得我们能够对基因进行操作和改造。通过对酶的深入研究和应用，我们能够实现对基因的精确编辑和操控，从而为生物技术的发展和应用打下了坚实的基础。
总结起来，基因工程的酶学基础主要包括限制性核酸内切酶、DNA连接酶和DNA聚合酶等酶的应用。限制性核酸内切酶能够识别和切割DNA中的特定核苷酸序列，而DNA连接酶负责将DNA片段连接起来，DNA聚合酶则在DNA复制过程中合成新的DNA。这些酶在基因工程中发挥着重要作用，为我们提供了强大的工具和技术，使得我们能够对基因进行编辑和操控，推动了生物技术的发展和应用。
