吉尔吉斯白桦转录组SSR分析：丰富的EST-SSR标记资源

"白桦EST资源的SSR信息分析" 是一篇由杨成君、李桂英等人撰写的论文，该研究关注的是吉尔吉斯白桦（Betula kirghisorum）的转录组中简单序列重复（SSR）的特征与分布。通过分析60545条表达序列标签（ESTs），研究人员发现了9047个SSR，这些SSR由1129种不同的重复基元组成，存在于6613条EST序列之中，出现频率为14.94%。这意味着平均每5.07千碱基对（kbp）就能找到一个SSR。 SSR，也称为微卫星或短串联重复序列，是DNA序列中的一种高度变异性标记，常用于遗传多样性研究和分子标记开发。在这项研究中，二核苷酸和三核苷酸重复是最常见的SSR类型，分别占总数的44.08%和27.31%。六核苷酸重复紧跟其后，占17.06%。其他类型的重复序列，如四核苷酸、五核苷酸等，其比例均低于6%。在二核苷酸重复中，CT和AG是最频繁的基元，而在三核苷酸重复中，AAG和TTC最常见，分别占比13.3%。 这项研究的结果表明，吉尔吉斯白桦的EST数据库中SSR的丰富度高，为开发具有多态性的白桦微卫星标记提供了大量的候选序列。这将有利于遗传学研究、种质资源鉴定以及育种工作。该论文是首次发表的研究成果，得到了高等学校博士学科点专项科研基金资助。 关键词：吉尔吉斯白桦、表达序列标签、简单重复序列 中图分类号：S718.46 文章的完整标题是"白桦EST资源的SSR信息分析"，作者团队通过深入的生物信息学分析，揭示了白桦基因组中的SSR模式，这为未来对白桦进行遗传研究和分子标记开发奠定了基础。