抗人4-氨基丁酸转氨酶的新型抑制剂的筛选和鉴定：一种计算方法

埃及基础与应用科学杂志5（2018）210完整文章抗人4-氨基丁酸转氨酶的新型抑制剂的筛选和鉴定：一种计算方法S. Vijayakumara，G.Kasthuria，S.Prabhub，P.Manogara，N.帕拉梅斯瓦里c计算植物化学实验室，P.G. 和植物学和微生物学研究部，A.V.V.M.Sri Pushpam College（Autonomous），Poondi 613 503，印度泰米尔纳德邦坦贾武尔县b印度泰米尔纳德邦Thanjavur-613 007，Annai Vailankanni艺术与科学学院（Bishop Sundaram校区）植物学系c印度泰米尔纳德邦帕拉尼Arulmigu Palani Andavar艺术与文化学院动物学系阿提奇莱因福奥文章历史记录：2018年1月28日收到2018年5月6日收到修订版，2018年在线发售2018年保留字：4-氨基丁酸转氨酶（GABA）受体分子对接ADME植物化合物A B S T R A C T4-氨基丁酸氨基转移酶（GABA）受体是哺乳动物中枢神经系统快速抑制性突触传递的关键介质GABA受体功能障碍导致遗传性疾病和慢性神经系统疾病，包括儿童失神性癫痫、青少年肌阵挛性癫痫、青少年肌阵挛性癫痫和癫痫发作。 它们受到大脑中GABA亚基基因突变的影响。神经系统疾病如亨廷顿舞蹈症、阿尔茨海默病、癫痫和帕金森综合征都是由于GABA水平的突变而引起的。因此，本研究从31种药用植物中选择了32 个 分 子 ， 之 后 我 们 执 行 了重 要 的计 算 方 法 ，如 同 源 建 模 ， 分 子 对 接 和 吸 收 ， 分 布 ， 代 谢 和 排 泄（ADME）。在计算方法中，类似物O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]呋喃戊糖基-（1-3）吡喃戊糖基-（1-4）戊糖显示出优异的对接得分为-9.336，具有良好的结合亲和力。天然产物迷迭香酸、姜黄素和芒果苷与优级品接近基于这一审查，我们得出结论，排名靠前的分子可以被认为是GABA引起问题的合适的候选药物。©2018曼苏拉大学。由爱思唯尔公司制作和主持这是一篇开放获取的文章，CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）。介绍4-氨基丁酸转氨酶（GABA）受体是哺乳动物中枢神经系统中快速抑制性突触传递的关键介质[1]。其可怕的条件成为参与催化氨基丁酸转氨酶（ABAT，GABA转氨酶）的早期阶段[2]。它分为三种受体，即GABAA，GABAB和GABAC[3这些都主要受神经系统GABA亚单位基因突变的一般来说，GABA具有维持大鼠和人类低血压的能力[8此外，GABA水平的不足导致了中枢神经系统的各种神经问题。特别是，癫痫是一种最常见的神经系统疾病，也是由于缺乏c-氨基丁酸而引起的。癫痫是一种主要累及中枢神经系统的神经系统疾病。抑制*通讯作者。电子邮件地址：svijaya_kumar2579@rediff.com（新加坡）Vijayakumar）。据报道，GABA介导的抑制性神经传递或由于多巴胺能或胆碱能传递引起的兴奋增加在癫痫的发生中起着重要作用[13]。全世界有近5000万人患有癫痫，影响不同年龄组和性别[14]。80%的癫痫负担在发展中国家，其中80目前，有多种药物可用于治疗癫痫及其相关问题，包括丙戊酸盐、拉莫三嗪和托吡酯。这些药物分子被鉴定为引起几种副作用使用时间较短，生物可及性较低[16]。因此，本研究正在寻找对人类癫痫具有良好可及性的替代药物分子。GABA对人类健康的影响是对食品机械化的巨大兴趣的挑战在市场上，有很多含有GABA的食品，包括发芽糙米，巧克力，葡萄酒和其他食品[17]。近几百年来，天然植物及其产品一直被用于治疗世界各地的许多疾病和病症。近年来，许多民族植物学研究报道了药用植物及其活性分子对中枢神经系统、https://doi.org/10.1016/j.ejbas.2018.05.0082314- 808 X/©2018曼苏拉大学。由爱思唯尔公司制作和主持这是一篇基于CC BY-NC-ND许可证的开放获取文章（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）。可在ScienceDirect上获得目录列表埃及基础与应用科学杂志杂志主页：www.elsevier.com/locate/ejbasS. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210211致病性疾病等[18]。药用植物衍生的次生代谢产物如生物碱、黄酮、单宁、皂苷和其他植物化学物质在利用时具有潜在的生物作用[19]。在世界范围内，发达国家33%的庞大人口和工业发展中国家80%以上的人口已经使用草药产品来维持人类健康和治疗某些气候变化、食物和水相关疾病，如感冒、发烧、心脏病、糖尿病等[20目前，人们对药用植物及其产品的依赖和信任，是因为它们具有良好的治疗作用和生物利用度。 因此，我们开展了同源模建、分子对接、药物设计和ADME分析等计算研究，以期找到合适的药物分子。通过这些分析，我们发现了一些有效的药物类似物，从药用植物癫痫。材料和方法软件和硬件计算分析在Schrodinger软件包的Maestro v10.2中进行。对接工具在单一软件中复杂地编程为Maestro v10.2，其包括用于同源性建模的prime应用程序、用于配体制备的Ligprep、用于验证结合位点的Sitemap、用于固定靶位点的网格生成和用于对接目的的Glide XtraPrecision。Centos Linux被用作计算考试的操作系统。目标从已建立的数据库中检索人4-氨基丁酸氨基转移酶（GABA）序列（登录号P80404）[23]。配体分子共选择了32种植物成分与靶标进行在先前文献报告的帮助下选择天然分子（表1）（补充数据）。这些分子是从已建立的化学数据库中获得的[24]。同源模建和蛋白质制备通过使用Maestro v10.2中的主要应用程序进行同源建模以预测目标[25，26]。 在结构预测过程中，我们面临着一些重要的步骤，如寻找同源物，BLAST同源性搜索和显示序列的相似性和与已知模板序列的同一性。最后，建立了目标模型，可以进一步用于对接目的。 利用Schrodinger软件包中的向导工具将预测的靶点用于蛋白质制备。在此过程中，添加了缺失的侧链和骨架，并更新了缺失的残基also.向导工具包含两个重要机制，即准备和细化。靶的X射线晶体学结构与水分子密切相关。水分子占据的目标是没有资格进行进一步的研究，因此，它被排除。最后，对该过程进行优化和最小化步骤[25]。活动场地验证和网格生成通过使用站点地图工具[27]分析目标内部和表面区域的站点确认。位点图分析显示了可能的活性结合位点，并选择了一个结合位点进行进一步处理。它是根据他们的网站价值（网站得分和网站面积的大小然后，选定的网站被用于网格生成。网格框形状和值以X：5.3;Y：3.71; Z：-20.86坐标生成用配体结合位点周围10 A°C半径解释靶位点[28]。配体制备使用ligprep工具将32个配体分子的结构从2D转换为3D结构[29]。配体 通过Optimized Potentials for Liquid Simulations 2005 （ OPLS2005）力场进行几何优化[30]。所有配体分子均由1D（Smiles）和2D（SDF）表示生成3D结构，探测互变异构体和空间异构体以及配体的几何最小化[31]。分子对接分子对接研究用于在Glide Xtra精密度（XP）对接模式下执行它被用来预测目标与配体之间的结合亲和力、配体效率和配体对目标的抑制常数通过使用Glide Xtra precision（XP）将32个配体的复合物与靶标的活性位点对接，该Glide Xtra precision（XP）可灵活对接配体[32高能小分子将具有可接近的姿态，从而避免这些惩罚，并且也获得良好的对接分数。它揭示了靶标与配体之间具有精确的疏水接触。ADMET分析该分析由Masetro v10.2的Quikprop工具进行[35]。所有配体分子都用氢键供体、氢键受体、血脑屏障和中枢神经系统的参数进行了分析，[36]第30段。结果和讨论同源模建蛋白质数据库中没有人4-氨基丁酸氨基转移酶的晶体结构。因此，本研究以猪4-氨基丁酸氨基转移酶为模板，通过同源模建预测了目标模型。在结构预测过程中，分析代表了靶和模板之间的序列相似性和同一性该结构已从人4-氨基丁酸氨基转移酶的序列中预测。与猪4-氨基丁酸氨基转移酶模板序列一致性和相似性。该研究靶标在PDB ID：10HV的序列中一起发现（图1B）。①的人。结构验证通过Ramachandran图分析结构验证，该图显示了残基发生区域。它还代表了模板和靶标之间残基的准确性和可靠性。在本验证中，87.3%的残基主要出现在有利区域，11.7%的残基出现在额外区域，0.7%的残基出现在宽松允许区域，剩余的0.3%的残基出现在有利区域。212S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210Fig. 1. 人和猪4-氨基丁酸转氨酶的序列比对。图二、智人GABA模型的结构验证。（a）Ram噬菌体显示了以猪4-氨基丁酸-氨基转移酶为模板的序列的准确性和可靠性该图显示87.3%的残基主要出现在有利区域;（b）通过使用Procheck验证主链参数残基存在于不允许的区域中（图1）。 2 a）。然而，使用Procheck工具检查预测模型构象方面的主链参数此前，Iftikhar等人，[37]以猪4-氨基丁酸转氨酶为模板预测人4-氨基丁酸转氨酶的结构通过同源性建模，分析了同一靶标和模板中此外，他们还报道了用于结构验证的Ramachandran图。可用药部位分析在这项研究中，位点分析产生了五个活性药物结合位点的目标。位点图显示它们的结合腔残基为Gln267、Hip162、Glh231、Asp264、Val138、Tyr161、Arg164、Gly163、Gly134、Lys293、Ser133、Val75、Gly298、Pro300、Ala296、Asn132、Leu299、Ser302、Ile295、Gly235、Leu301和Gln267（图3）。同样，Iftikhar等人，[37]分析了4-氨基丁酸转氨酶中的配体结合位点，S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210213---图三.分子结构代表GABA与活性残基的配体结合腔。与已知类似物对接。最近，许多计算研究已经在许多种类的靶分子中进行了这种结合位点分析方法[38，39]。此外，Vijayakumar等人，[40]描述了Maestro v 10.2，Schrodinger套件中结合位点分析的潜力。作为该分析的结果，将合格的结合位点用于网格生成，这有助于确定靶点中可能的结合位点[41]。分子对接在人4-氨基丁酸氨基转移酶分子中与实验报道的和已知的生物活性分子进行分子对接。其中，与其他配体分子相比，5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]呋喃戊糖基-（1-3）吡喃戊糖基-（1-4）戊糖的对接得分更高，为9.336（表2）。它还显示出与蛋白质分子更好的结合亲和力。当与放置生物活性分子的优异对接分数相比时，迷迭香酸、姜黄素和芒果苷流动显示最接近的对接分数。通过分子对接，我们发现在配体中有四个生物活性分子与人4-氨基丁酸转氨酶的靶点获得了良好的对接评分。这些配体表现出与靶受体的良好对接分数，其源自8.224的对接分数。通过散点图，整个配体分子的对接分数与它们的滑动表示在图1B中。 四、近年来，人们利用计算机进行了大量的研究，以寻找有效的药物分子来对抗某些全球性的微生物及其疾病。计算分析为我们提供了一些重要的事实，如对接得分，结合能，结合亲和力，并指出配体的潜力。一般来说，结合亲和力特别显示配体贡献和与配体的灵活性。蛋白质的活性部位。综合考虑，我们发现了这类配体与靶点的对接参数和结合亲和力，主要涉及侧链氢键、背链氢键和Pi-Pi堆积接触。5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖该配体分子的有效对接分数为9.336。表2显示了配体对接得分及其能量值。它已显示出良好的可数结合亲和力的残基人4-氨基丁酸氨基转移酶在这一点上，如此多的结合接触参与靶残基。一些相互作用取决于与配体结合位点的特异性相互作用和靶结合腔外部的非特异性力。配体与靶点之间存在不同的结合亲和力。准确地说，氢键侧链，背链和Pi-Pi堆叠接触涉及两个分子之间。研究了配体与蛋白质的复合物，分析了它们的接触形成。对接复合物的检查表示靶与配体之间的六个键形成。其中，与配体原子接触的一些活性残基是Gly134、Arg164、Tyr161 、 Leu299 、 Gln267 和 Gly298 （ 图 5a ） 。 其 中 Gly134（OH）、Arg164（O）、Leu299（OH）和Gly298（OH）等4个残基接触属于氢键背链（图5b）。该分子通过形成p-p堆叠接触而相互作用。Gln267（OH）通过形成侧链与配体的官能团接触。这里，蓝色虚线表示氢键侧链。蓝色实线表示的是主链上的氢键。而且，哑铃形的绿线表示Pi-Pi堆叠接触。同样，我们以前的计算研究报告说，类似物已显示出更好的对接分数与良好的结合接触乙酰胆碱酯酶（AChE）酶。乙酰胆碱酯酶，214S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210表2与人4-氨基丁酸-氨基转移酶一起接收的配体分子的对接评分和滑移能值3.姜黄素-8.427-47.631-4.35C21 H 20O 64.芒果苷-8.224-47.462-2.639C19H18 O115.鞣花酸-6.35-35.284-2.266 C14H6 O86.印楝素-6.211-50.992-3.764C35H44 O167.穿心莲内酯-5.756-29.584-2.56C20 H 30O 58.D-（+）-儿茶素-5.496-39.259-2.496C15 H 14O 69.表儿茶素-5.438-41.206-3.01C15 H 14O 610.白果内酯-4.952-30.76-1.849C15 H18 O 811.二甲基烯丙基二磷酸酯-4.328-39.687-2.854 C20H36 O7 P212.外消旋8-异戊烯基柚皮素-4.276-39.628-3.718 C20H20 O513.丁香酸-4.04-28.168-1.458 C9H10 O514.丁香酚-3.894-25.424-2.421C10 H 12O 215.欧前胡素-3.868-35.178-2.866C16 H 14O 416.香芹酚-3.867-23.084-2.454C10 H 14O17.芹菜素-3.818-36.071-2.176C15 H 10O 518.银杏内酯-B-3.732-29.047-1.26C20 H 24O 1019.1.989C10 H 18O-3.438 -16.16920.g-托考菲醇-3.346-36.401-3.193C28 H 48O 221.（+）-L-蒜氨酸-3.307-24.253-1.13C6 H 11 NO 3S22.三氟甲磺酸盐-3.106-19.239-1.083C2 H 3 F 3 O 3S23.油酸-3.06-33.412-1.466 C30H48 O324.L-（-）-甲萘醌-2.909-13.814-1.583C10 H 20O25.环氧卡环烯-2.879-16.735-1.728 C15H24 O26.（-）-芳樟醇-2.753-20.642-2.443C10 H 18O27.2-环己烯醇-2.53-17.244-1.413C6 H 10O28.熊果酸-2.272-28.858-1.73C30 H 48O 329.（6 E）-1，6-辛二烯-3-醇-1.954-21.703-1.709C8 H 14O30.小檗碱-1.648-28.011-2.164C20 H 18 N O 431.大蒜素-1.514-31.163-1.933C6 H 10 O S 232.（E）-阿焦烯-1.391-35.145-2.378C9H14 O S3见图4。 散点图显示配体对接分数及其能量值。一种有机物质，它有助于大脑中神经信号的传递。乙酰胆碱酯酶（AChE）是公认的在中枢神经系统（CNS）中起重要作用的酶。已经，我们报道了分子5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙酰基]戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖显示出良好的对接得分，与AChE酶具有良好的接触。S. 号植物成分对接得分滑翔能亲脂性EvdW分子式1.5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖-9.336-58.733-3.671C24H32O 152.(R)-(迷迭香酸-8.687-59.972-4.001C18H 16O 8S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210215图五.靶标与5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖的分子相互作用：残基和氢键接触（黄色虚线）及其距离值（粉色值），2D模板代表配体和靶标之间形成的接触类型因此，我们认为该分子可能具有良好的神经元疾病抑制能力[25]。迷迭香酸在 32 个 配 体 中 ， 迷 迭 香 酸 具 有 第 二 有 价 值 的 对 接 得 分 （ -8.687）。对接复合物的分析表明，残基接触为Gly298、Leu299、Gln267、Gln231、Asp264和Tyr16。图6a以粉红色示出了残留接触及其距离值。在 7 个残基接触中， Gln267 （ OH ）、 Glh231（OH）、Asp264（OH）和Tyr261（O）与配体形成氢键侧链接触Gly298（OH）和Leu299（OH）参与了与迷迭香酸的氢背链接触令人惊讶的是，残基Tyr 261参与了两个侧链以及与配体的p-p堆积接触（图1B）。 6 b）。迷迭香酸是鼠尾草属植物中特有的生物活性分子，鼠尾草属植物中还含有夏枯草、香蜂花等药用植物。它减少了Ab诱导的有害作用的数量，包括活性氧簇构型、脂质过氧化、DNA破坏、半胱天冬酶-3建立和蛋白质过度磷酸化[42]。药用含有该分子的植物已被开发为有效的神经活性。鼠尾草是治疗11轻度至中度症状有阿尔茨海默病患者，有它显着改善认知功能[43]。这显示了与人4-氨基丁酸转氨酶靶标的良好对接评分（表3）。姜黄素姜黄素具有第三有价值的对接得分（-8.427）。对对接复合物的研究表明，接头为Leu299、Leu301、Ala135、Gln267、Arg164和Tyr161。其中，Leu299（OH）、Leu301（O）、Ala135（O）和Arg164（O）残基参与了与配体的氢键背链接触。Gln 267通过侧链形成氢键与姜黄素接触，残基TYR 161参与p-p堆积与姜黄素接触.图7a示出了残余接触，并且它们的距离值是粉红色的。 图图7 b显示了它们的结合接触类型。姜黄素主要存在于药用植物姜黄中。姜黄的药理作用已被主要承认。姜黄素类化合物由姜黄素和两种缔合分子脱甲氧基姜黄素（DMC）和脱甲氧基姜黄素（DMC）组成。见图6。靶标与（R）-（+）-迷迭香酸的分子相互作用：残基和氢键接触（黄色虚线）及其距离值（粉红色值），以及代表配体和靶标之间形成的接触类型的2D模板216S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210表3人4-氨基丁酸转氨酶（GABA）残基与受试分子的相互作用（2.73），赖氨酸293（2.73）见图7。靶标与姜黄素的分子相互作用：残基和氢键接触（黄色虚线）及其距离值（粉红色值），以及代表配体和靶标之间形成的接触类型S. 号植物化合物残基相互作用及其距离值键形成氢键骨架氢键侧链1.2.5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖(R)-(迷迭香酸Gly 134（2.46），Arg 164（2.46），Tyr 161，pi-pi堆积，Leu299（2.23），Gly298（1.97，1.79），Gln 267（2.66）天冬氨酸264（1.82），谷氨酰胺267（2.27），谷氨酰胺231（2.57），酪氨酸161Gly 134，Arg 164，Tyr161，Leu 299，Gly 298天冬氨酸264，谷氨酰胺267，甘氨酸298，亮氨酸2993.姜黄素（1.81），Gly 298（2.12），Leu 299（2.67）谷氨酰胺267（2.04），精氨酸164（2.51），亮氨酸299（1.78），亮氨酸301谷氨酰胺231，酪氨酸161，精氨酸164，亮氨酸299，谷氨酰胺267，4.芒果苷（2.11）、Ala 135（2.12）Glu 236（2.16）Gly 134（2.66），Lys 293（2.24），Leu299Leu 301，Ala 135甘氨酸134，亮氨酸299，谷氨酸236，精氨酸1645.鞣花酸共价键（2.16，2.11），Leu 301（1.93），Arg 164（1.90）Gly 134（2.14），Leu 301（2.05），Leu 299共价键赖氨酸293，亮氨酸301Gly 134，Leu 301，Lys 293（2.06）、赖氨酸293（2.55）Leu 2996.楝素酪氨酸161（1.96），精氨酸164（1.74）–7.8.穿心莲内酯D-儿茶素丙氨酸135（2.06）、亮氨酸301（2.20）谷氨酰胺267（2.42），谷氨酰胺231（2.93），天冬氨酸264（1.77），酪氨酸161，丙氨酸Ala 135，Leu 301天冬氨酸264、酪氨酸161、谷氨酰胺267、谷氨酰胺2319.表儿茶135（2.36），赖氨酸293（2.75）Asp 264（1.63，1.82），TYR 161 pi-pi堆叠，Ala 135Ala 135，Lys 293丙氨酸135，赖氨酸293，天冬氨酸264，10.11.白果内酯二甲基烯丙基二磷酸赖氨酸293（2.19），天冬氨酸132（2.44），谷氨酰胺298（2.06）丙氨酸135（1.90），甘氨酸134（1.94.），赖氨酸293（2.27）赖氨酸293，天冬氨酸132，谷氨酰胺298丙氨酸135甘氨酸13412.Rac 8-异戊烯基柚皮素天冬氨酸264（1.86），酪氨酸161（2.52）pi-pi堆积赖氨酸293–13.丁香酸Gln 267（2.38），Ala 135（1.82），Tyr 161 pi-pi堆积丙氨酸135谷氨酰胺26714.丁香酚Asp 264（1.93），Tyr 161 pi-pi堆积天冬氨酸26415.16.9-[（3-甲基-2-丁烯-1-基）氧基]-7H-呋喃并[3，2-g]色烯-7-酮香芹酚谷氨酰胺267（2.29），酪氨酸161 π-π堆积His 162（1.83），Tyr 161 π-π叠加谷氨酰胺267他的16217.18.芹菜素（-）-异黄酮Gln 231（2.10），Asp 264（1.76），Lys 293盐桥，Tyr161 pi-pi堆叠酪氨酸161（1.91）谷氨酰胺231，天冬氨酸264–19.g-生育酚Asp 264（1.71），Tyr 161 pi-pi堆积–20.21.（+）-L-蒜氨酸三氟甲烷磺酸甲酯Asp264（1.78）、Tyr161（1.17）、LYS 293盐桥、Gln267（1.82）亮氨酸301（1.82），赖氨酸293（1.95）Tyr 161 Gln 267，Asp 264Leu 301，Lys 29322.23.齐墩果酸6-甲基-2-环己烯-1-醇精氨酸164（2.15）、酪氨酸161（1.51）、谷氨酰胺298（1.94）他的162（1.81）精氨酸164、酪氨酸161、酪氨酸161谷氨酰胺298他的16224.25.L-（-）-甲氨蝶呤4，5-环氧-4，11，11-三甲基-8-亚甲基双环酪氨酸161（1.95）酪氨酸161（2.11）–Tyr 161–Tyr 16126.（7.2.0）十一烷芳樟醇丙氨酸135（2.02）丙氨酸13527.2-环己烯醇谷氨酰胺231（2.22）、谷氨酰胺267（2.43）谷氨酰胺231、谷氨酰胺267S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210217双脱甲氧基姜黄素[44，45]。它对某些有害病原体具有有效的抗菌特性。姜黄素已消耗尽可能多的人类健康投诉的疾病和障碍。姜黄素，它抑制II型糖尿病及其相关症状，类风湿性关节炎，多发性硬化症（MS）和阿尔茨海默它抑制人类免疫缺陷、病毒（HIV）复制，增强伤口愈合特性，防止肝损伤，增加胆汁分泌，这也防止白内障形成，防止肺毒性和纤维化。此外，它还具有抑制利什曼病和抗动脉粥样硬化的活性。此外，广泛的文献表明，姜黄素具有预防和治疗许多健康问题的有效生物活性[42]。此前，Erfani等人，[46]他说，效果见图8。靶标与芒果苷的分子相互作用：残基和氢键接触（黄色虚线）及其距离值（粉红色值），以及代表配体和靶标之间形成的接触类型表4QuikProp分析受试分子的理化性质和生物功能值-1.446-2MWS. 号植物成分MWSasaFISAIP施主H键受体氢键BBBCNSOA代谢1.5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基] 560.508戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖767.581410.3159.224722.45-4.673-2182.3.4.5.6.7.8.9.10.11.12.13.14.15.16.17.- （R）-（+）-迷迭香酸姜黄素芒果苷鞣花酸印楝素穿心莲内酯D-（+）-儿茶素表儿茶素白果内酯二甲基烯丙基二磷酸酯外消旋8-异戊烯基柚皮素丁香酸丁香酚-[（3-甲基-2-丁烯-1-基）氧基]-7H-香芹酚芹菜素360.32368.385422.345302.197720.723350.454290.272290.272326.302450.448340.375198.175164.204270.284150.22270.241661.858674.36637.514452.214866.694560.058509.649513.921425.57641.258622.17392.802392.915523.616389.572492.236336.413153.896367.311326.02150.339161.781239.383234.526206.11237.992167.764137.64739.59266.10444.585204.2278.8988.8479.0289.29.92310.1158.8558.74911.3869.5259.0139.0688.8888.9659.1299.05652743355202210127713819.058.15.455.4511.451044.251.53.750.753.75-3.743-1.758-3.601-2.375-1.38-1.206-1.868-1.851-0.995-0.584-1.378-0.791-0.001-0.2230.08-2-2-2-2-2-2-2-2-1-1-2-100113122322233333336510456773083353318.19.20.21.22.23.24.25.26.27.28.29.30.31.32.6，12，17-三羟基-16-甲基-8-（2（-）-异丁酮g-托可菲醇（+）-L-蒜氨酸三氟甲磺酸甲酯6-甲基-2-环己烯-1-醇L-（-）-薄荷脑-4，5-环氧-4，11，11-三甲基-8-甲基13849981-芳樟醇-2-环己烯醇熊果酸（6 E）-1，6-辛二烯-3-醇小檗碱（E）-阿焦烯424.404154.252416.686177.218164.099456.707112.171156.267220.354154.25298.144456.707126.198162.264494.879389.781834.983381.056293.78689.988319.992400.546470.864432.413296.281658.555388.26377.755218.08639.44845.643160.805101.26997.61638.94140.738033.08149.28195.59341.51741.70410.91510.4368.3889.49212.1529.7619.98210.9269.7669.4939.7999.1499.8829.4672012021101121712.921.5643.71.71.720.751.73.71.74-1.1460.199-0.72-0.6470.01-0.4110.210.1210.134-0.0210.135-0.366-0.0880.065-21-1-11-111101-1012311313333313242450321242333218S. Vijayakumar等人/埃及基础与应用科学杂志5（2018）210-姜黄素治疗癫痫的效果他们指出了不同浓度水平的姜黄素对各种临床实验即白化大鼠、瑞士小鼠和斑马鱼的有效性首先，我们发现姜黄素具有抗癫痫的生物学活性，并通过分子对接的方法进行了验证在这项研究中，姜黄素分子比芒果苷和其他分子具有更好的对接分数芒果苷芒果苷具有第四个有价值的对接评分（8.224）。它还显示出与靶残基的良好结合亲和力。这种对接的复合物显示靶标与芒果苷之间的残基接触。该检查显示配体与靶标之间存在六种结合亲和力。在此，残基Arg164、Glu236、Lys293、Gly134、Leu299和Leu301与芒果苷小分子形成不同的接触。特别地，残基Arg164（OH）、Glu236（OH）和Lys293（OH）参与氢键侧链接触。而在残基Gly134（O）之后，Leu299（OH）和Leu301（OH）参与氢键后链接触。而Leu299残基与配体羟基离子结合。图8a.表示残基接触及其保留距离值。图8b显示了配体原子中的残基接触及其接触类型。在本研究中，所有受试化合物接触见表3。芒果苷主要存在于芒果中。它具有有效的药理学特性，也包含许多健康益处，包括免疫调节、心脏保护、增强记忆、抗病毒、通便等。芒果及其分子芒果苷的重要性和潜力在先前的发现中已被清楚地报道[47]。ADMET分析在药物发现的开始阶段，使用理化指标以发现影响生物功能的重要性质（ADME）表4。测定了渗透性、溶解性、亲油性、完整性和稳定性等重要理化性质。但ADME的概念因其毒性作用而扩大。从药物发现开始，计算机模拟方法就被用于准确预测即时ADMET的药代动力学特性。结论氨基丁酸是哺乳动物中枢神经系统的重要神经递质。由于缺乏GABA水平，人们受到某些神经系统疾病的影响但是，这些GABA酶在发芽的糙米、巧克力、葡萄酒等中更有效。基于药用植物部分中GABA的有效性，通过使用计算方法用GABA测试植物成分作为该计算发现的结果，一些分子如5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙炔酰基]戊呋喃糖基-（1-3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖、（R）-（+）-迷迭香酸、姜黄素和芒果苷显示出有利的对接得分并显示出与靶标的良好接触。为了计算的结果，我们已经发现了一些积极的新的药物类似物的神经系统疾病的癫痫。特别是5-O-[（2 E）-3-（4-羟基苯基）-2-丙烯酰基]戊呋喃糖基-（1- 3）戊吡喃糖基-（1-4）戊糖，其计算结果优于其它三种同类物。基于这一发现，我们得出结论，上述分子可能是合适的候选药物治疗癫痫。同时，本研究也将对医药界新草药的发现有很大的确认作者感谢DST-SERB（SB/YS/LS-109/2014）为该项目提供财政援助。我们特别感谢A.V.V.M.的管理层。斯里兰卡Pushpam学院（自治），Poondi，为他们提供必要的设施和支持，以开展这项工作。附录A.补充数据与本文相关的补充数据可以在https://doi.org/10.1016/j.ejbas.2018.05.008的在线版本中找到。引用[1] McGeer PL，Kawamata T，Walker DG，Akiyama HI，Tooyama McGeer EG.小胶质细胞在退行性神经疾病中的作用。 Glia 1993;7：84-92.[2] Medina-KauweLK ， Tobin AJ ，De Meirleir L ，Jaeken J ，Jakobs C ， NyhanWL，等. 4-氨基丁酸转氨酶（4-氨基丁酸转氨酶-转氨酶）缺乏。J Inherit Metab Dis1999;22：414-27.[3] SabeegaBegum B ， Subashini S ， Hemalatha P ， Archana P ， Bharathi N ，NagarajanP ， et al. 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