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在线 Available atwww.sciencedirect.comScienceDirect科学空间 研究 xxx ( xxxx )xxxwww.elsevier.com/locate/asr太阳 物理 社区 中 的 Python ( PyHC ) : 当前 状态 和 未来Outlook 的Julie 朱莉巴纳姆A A,✔,Arnaud Masson B,Reinhard h . w 。 弗里德 尔C,Aaron罗伯茨DBriana . 托马斯DA A美国 科罗拉多 大学 博尔德 分校 大气 与 空间 物理 实验 室 , 1234 Innovation Dr , Boulder , CO 80303 USABTelespazio 空间UK for the European 欧洲space Agency) ,European 欧洲space天文 学中心 ,路BAJO Del Castillo 城堡s/n ,28692 Villafranca 的Del Castillo , 马德里 ,西班牙CLos Alamos全国实验 室 ,Los阿拉 莫斯 ,NM 87545, USAD全国Aeronautics 航空而space行政 管理( NASA )Goddard 合作space Flight中心 ,8800 Greenbelt RD ,格林贝 尔 ,MD 20771,USA接收31一 月2022 年 ;收到在Revised Form 20九 月2022 年 ;接受1十 月2022Abstract从太阳物理学社区的Python形成以来已有四年了。当时,社区已经做出了巨大的努力,促进并实施了太阳物理框架的理想。”Burrell et al (2018)。Specif—ically ,the components of such a framework include :1)centralization of current Pythonpackages;2)增加这些项目的可访问性和有用性;3)考虑软件属性问题;4)代码开发的最佳实践和标准的构建和实施。我们描述的人在哪里,以及什么是最先进的,PyHC已经实现了这四个Tenants。我们将为PyHC的未来提供建议,包括我们可以改善信息架构的方法,我们如何发展我们的社区,以及项目可持续性和使用条款,以及如何成为城市的社会组成部分—弹药本身,我们如何改善PyHC包集成,以及如何确定非Python库方面。PyHC 的 使命 和 战略 目标 , while helping better integrate PyHCinto the broader Heliophysics and Space Weather community 的 建议 改进 和 补充E 位置 。©2022 COSPAR 。 Published 出版By Elsevier B . V 。 this IS AN open 开放access 访问Article 文章Under the cc by License(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).Keywords :Heliophysics ; OPEN来源软件 ; Python ; Software可 互 操作 性 ; Software可 持续 性 ;信息architecture1. introduction介绍一种增加数据分析的流行方法涉及使用开源软件。Python 2013开源软件开发工具包(Rossum,1995年).Python 是 一 个 流行 的 社区 驱动 , 开源 语言 , 与广泛 的 规范 - 开发packages”(Burrell 。et 阿尔 ,2018). 谢 文包子 -◎ ◎ Corresponding 相关作者 .Email address :作者 : Julie . Barnumlasp.colorado.edu( J 。 巴纳姆 ) 。Heliophysics and Space Weather Community中的信息已开始将Python纳入其软件工具创建工作。However认为,软件开发是一个孤立的、个性化的地方。Python工具在功能上被过度使用,增加了多余的工具,不太好集成或互操作的工具,采用了不同标准级别的工具(如果任何规范被应用),以及社区参与开发的工具。首页 >外 文书 > 人文 > 心理 励志 > In short , the Heliophysicsand Space WeatherPython Community 社区需要A A一致通过Framework 工作https://doi.org/10.1016/j.asr.2022.10.0060273-1177/© 2022 年 , COSPAR 。由 Elsevier 出版B . V 。Please cite this article as:J.巴纳姆,A.马森,R。h. W。Friendly et al.,太阳 物理 学 社区 中 的 Python ( PyHC : Current status andfuture outlook , 空间 研究 进展 , 2013 年 )https://doi.org/10.1016/j.asr.2022.10.006thisIS AN open 开放access 访问Article 文章Under the cc by License(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx22013 年 国 际 合 作 项 目 进 展 情 况 及 合 作 项 目(McGranaghan等。 2017).Burrell et al. ( 2018 ) described an initial plan forcarrying out the above desire.在最初的计划下,将超出预期 。 2013 年 12 月 30 日 @ 下 午 12 时 40 分 i = AsianCollaboration et al.,2013). Burrell et al. ( 2018 )我们 可以 通过 集中 化 的 当前 Python 包 , 增加 可用 性和 said 项目 的 连通 性 , 解决 软件 属性 问题 , 以及作为 代码 标准 的 最 佳 开发 实践 的 建立 和 实施 来实现 。通过 与 这些 区域 进行 沟通 , 社区 支持 帮助制作 Python 软件 工具鼓励 开发 人员 之间 的 通信 ,减少 重叠 的 功能 和 重复 的 代码 , 同时 鼓励 更 好的 inte - gration 和 互 操作 性 Python heliophysics软件包 和 更 容 易 识 别 社 区 未 来 的 技 术 需 求 。《Thus ,the ' 》 在Heliophysics 中使 用PythonCommunity 社区[ 图文 ] [ 图文 ] 天生 一 对2018.PyHC目前是一个组织的监管机构,将核心Python包的开发移植到符合PyHC标准的版本中。这些包的封面包括太阳物理,太阳风,磁层,电离层和大气层的子域—SICS。Python 的 Tens 包 也 连接 到 PyHC 并 在PyHC 上 列出Website .本文由两个主要章节组成。2015年12月21日@下午12时28分@上午11时23分@上午11时40分@上午10时40分@上午11时40分@上午12时40分@上午11时40分@上午11时20分@下午5时40分@上午11时40分@下午5时40分@上午10时40分@上午10时40分@上午10时40分@上午10时40分@下午5分@上午10时40分@下午5分@上午10时40分@下午5分@下午5时40分@下午5分@下午5时41分@下午5分@下午5时41分@下午5时41分@下午5时41分@下午5分@下午5时21时40分@下午5时41分)=第二节). The Following 的2013 年 12 月 21 日@下午 11时 26 分 i = =第 三 节 3.1). Python 2013开源软件开发工具包(第3.2节).最 后 两 个 分支 与 多种 软件 包 的更 好 整合 以及 与 仍 由 Python 使用 的 非 Python 库 的联系 有关社区 .2. Current State of 当前 状态PyHC2.1. PyHC 社区Activities 活动2018年12月21日,中国移动有限公司(威尔et al.2019“ 我们 已经 发展 成为 一 个 活跃 的 社区 。您现在有62 个PyHC—a 高效项目,超过100 个人订阅PyHCGoogle邮件列表,以及20—30个人参与双向电信。七个精心策划的年度会议在下降和春天已经准备好积极参与,并在2021年夏天举行研讨会PyHC领导层讨论未来的技术优先事项。最近 , 最 好 的 PyHC 夏季 学校 在六 月 很 热闹2022.PyHC 的电信已经覆盖了广泛的主题范围,包括PyHC的未来技术优先事项,项目更新,introductions和demos , Discussions surround—ing potential fundingopportunities , 并向PyHC 以外 的社 区学习 ( 进入协作)。2015 年 12 月 26 日@上午 10 时 40 分 The bi-annual meetings resulted from discussions during saidtelecons , wheremem - bers expressed a desire to meetingto ' clarify the path forward and establish priorities . 他们表示 有 一 个 会议 的 愿望 , 以 确定 优先 事项 。”(威尔 et al. 2019).这些会议一般包括一些项目更新,外部演讲者与会议主题相关,开发人员可以同时并参与编码问题,并且可以在会议其余时间主持内部会议时不开会(如果社区讨论的主题与会议有关)。2018年浙江高考化学试题(Annex et al.,2018( Which Guide 社区 活动 和 项目 发展 )第 二 节 2.2for further informa -tion on the PyHC ( PyHC 上 进一步 的 信息 )标准 。PyHC已经在PyHC组织的会议中增加了。从 2018年 起 , PyHC 成员 已 组织会议 海报at the American美 国 Geophysical 地 球 物 理 union ( AGU ) meet-ing 。 谢 文of the PyHC Members 成员Have故称注意事项 、2013 年 12 月 21 日 , 国际 太阳 能 电池 联盟 (https://ihdea.net年度 会议 。PyHC 的 主要 成员和 领导 人 也 在 国际 上 领先空间 天气 SpaceWeather Action TEAMS (ISWAT ) https://iswat-cospar.org/国际空间研究委员会(COSPAR)。PyHC成员也出席并主持了许多其他会议和黑客周。These activities helppromote PyHC to the featuring 太阳 物理 学 与 空间 天气社区 .2.2. PyHCStandards 标准PyHC的后续部分参考了PyHC的标准两次。更 清楚地 了解 这些 标准 是 什么 , 以及 它们 如何 在 分级系统 中 发展 。第 2.3.4 节标准 总结 - Rized In Fig. 1下面 。本标准及其定义是直接和取消的阿姆斯壮et al.( 2018 )。2.3. 英文 名称 : PyHC as a HeliophysicsFramework 工作PyHC主要在成员,项目和活动方面进行了扩展。Where does the community stand in terms of meeting theneeds of a Heliophysics framework社区在哪里见面的需要一个太阳物理框架Burrell et al.(2018)?To achievethis goal达到这个目的下列主题如需确保PyHC软件包对社区有用,请参阅as to decrease redundancy andduplicated e-ports :central - ization of Heliophysics( 英语 : Heliophysics )包子 -J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx3Fig. 1. PyHC Standards 标准Grouping 的( used )for Project自我 评价 )with Their associated 相关Standards 标准而成果( AS陈 晓 晓在Annex et阿尔 , 2018).最 佳 实 践 、 最 佳 实 践 、 最 佳 实 践 ( Burrell et al.(2018))). We 'll each this now 我们 会 把 这个 给你topics 。2.3.1. Centralization中心Burrell 。et阿尔 ( 2018 )状态that the Community社区需要一 个 中心 化 的 位置 , 其中 一 个 可以 定位 信息 与 所有 当前 使用 并 维护 的 HeliophysicsPython 包 有关 。A package refers to a collection ofpython modules linked together under one name.一个包对 应 一 个 集 合 的 Python 模 块 。 Please note thatthroughout this paper , projects and packages are ( 没有 这 张 纸 , 项目 和 包 )used可 交换 的 。 to this结尾 ,one 一of the许 靖活动 - 城市Tackled By thePyHC 何为 两个 Create 创 建 the PyHC WEB(https://heliopython.org). the Website Now Serves 服务 AS A A 此 分 类 上 一 篇 : Stop shop for thoseinterested in discovering everything that PyHC欧 他Heliophysics Python packages 信息 分类covered 封面By the PyHC site 的Projects section . Therin ,J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx4PyHC成员和外部人员可以找到当前,开源HeliophysicsPython 包。目前,有62 PyHC—a Toyerliated projectsincludedonthispage , whichrunthegamutofHeliophysics domains(太阳能,太阳能风,磁层,以及 作 为 Iono—sphere , Thermosphere 和 Mesosphere 研究).这些软件包包括一个广泛的功能范围(例如建模,机器学习,绘图,协调跨格式,其他图书馆的包装和CDF Writ—ers)。信息是一个整体的功能包装,联系信息,一个链接到包的代码存储库和文件,就像它一样”(See)第2.3.4节(Associated with)variousGrouping的ofthePyHCStandards标准(see Fig.1).湖附录 Afor a listing of packages , along with ashort description of each package 's functionality . 在 这个列表 中 , 包 有 一 个 简短 的 描述 。软件 包 分为 两 个Category :J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx5CorepackagesEach core package provides a wide range of functionalities in their area and conform to the PyHC com—munity standards(PyHC的核心套件提供了一个广泛的功能范围——在其区域内的能力并符合PyHC的标准)当前核心软件包是Plasma Py,pysat,pySPEDAS,SpacePy和SunPy。最初,核心软件包是由origi—nal PyHC组织者选择的。Current ,core package inclu - sion is based on a decision madeby LASP and NASA PyHC leadership , as well asthe current Pycore HC ( 目前 的 Pycore HC ) 目前 , 核心 软件 包 基础 是 由 LASP 和 NASAPyHC 领导 的 决定packages 。' Other 其它packages”This category comprises packages that fithin the HCpyethos,but are more speci fifc in their functionality.这些分类是在其功能中定义的压缩包。The PyHC website on the PyHC site's Gallery sec—tion上的PyHC增加和数量的PyHC examples。此页面包含science use case examples from PyHC packages 。 索 尼ILCE - 2013 套机 (白兰地 ,2021),Which IS A Atool used for Creating 建 立 documenta - tion (inparticular , Python 文件 ) 。[ 转 ] Guage is based inreStructuredText , a plaintext , markup syntax 使用 说明而parser 巴黎系统(Goodgerplo ,2022). Sphinx 的10 月 21 日@上午 11 时 40 分@上午 11 时 26 分@上午11 时 26 分@上午 11 时 26 分@上午 11 时 26 分@上午11 时 22 分@上午 11 时 20 分@上午 11 时 20 分@下午7 时 40 分@上午 11 时 40 分@上午 12 时 40 分@上午10 时 40 分 (张 国荣 et al. ,2016 WEB WEB WEBWEB 是 生成 和 共享 计算 - 国家 文档 的 Web 应用 程序 。The Jupyter Notebooks in the PyHC Gallery 的 图片use Binder Links两 个ALLOW AN end user 用户两 个interact 的与 他们 。binder links provide '' an environmentthat runs and(提供运行和环境)interactively serves交互式服务... 2013年02月14日@下午12时26分i == ProjectJupyter et al.,2018).另外 , 用户 可以 下载 这些Jupyter 笔记 本 ( 或 Python 源 代码 ) 以 进一步 使用其 本地 工作 站投资 - - and/or sharing with others . 2.需要创建更多样本(特别是与项目间集成有关)。The website display information regarding the commu -nity itself ( 网站 显示 信息 )including 。主页由PyHC使命声明,战略目标和社区最近的博客文章组成.文档 页面 链接 到 PyHC 双 年度 报告 , PyHC 标准 ,ETCMeetings 页with Links for the PyHC 双 周 Weeklycons - cons ,the PyHC Google日历 ,Links两 个过去 双 向会 议 信 息, 而 related 相 关 Meetings( E.G. ) Links to an upcoming PyHC posts sessionat ( 作者 )AGU ) 。● PyHCpeople 人民页( With Links两 个成员Github 的Pages ) 。● Contact页 。2.3.2. PackageAccessibility 可 访问 性in Burrell et al. ( 2018 )使用 免费 和 开源 软件 的可 访问 性软件 ( FOSS )●●●●●●●J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx6有与福斯合作的许可证。· 符合 PyHC 标准all code必须be Made 的available 可 得而2013 中国 (Annexet al. ,2018 ). Projects 不 需要 to use a particularcode hosting platform . 使用 部分 代码 托管 平台 。2013 年 12 月 21 日@下午 12 时 29 分@上午 11 时22 分@上午 11 时 22 分@上午 11 时 22 分@上午 11时 40 分@上午 12 时 21 分@下午 5 时 21 分@下午 5时 21 分@下午 5 时 20 分@上午 12 时 41 分@下午 5时 40 分@下午 5 时 40 分@下午 5 分@上午 12 时 40分@下午 5 时 40 分@下午 5 分@下午 5 时 40 分@下午 5 分@下午 5 时 40 分@下午 5 分@下午 5 时 40分@下午 5 分@下午 5 时 (https://github.com/2 . 使用 GitHub (https://about.gitlab.com/).同尊重两 个PyHC Project 许 可 证 , the PyHC 标 准 决 定 thatprojects必须提供 商A A license 。 Projects should use使用许可licenses for open - -来源科学 FIC计算机 软件 (Annex et al. , 2018).2.3.3. SoftwareAttribution 的恐惧传染病在历史上一直是一个吸引科学家使用FOSS 和 Python 开 发 其 项 目 的 地 方 。 Burrell et al.(2018)该公司表示,软件引用和鼓励项目合作将有助于这些研讨会。PyHC Integration Strategy WorkshopReport:the importance to PyHC of [software citation] isfourfold:1)those interested in a career in science needscienti c currency to further that career.(PyHC [软件管理]的重要性是:1)这些人在科学领域需要进一步发展 货 币。 作品 名 称 : CITABLE WORK IS ALSOCITTED IN PEER REVIEWEDPublications , not justpotentially citable ) , 2 ) this gives PyHC packages( 出版 物 , 不 只是 潜在 的 市民 )an opportunity toadvertise their tools , 3 ) it advertises PyHC , drivingtra jüchtc to our community ( which would ideally thenincrease PyHC package usage ) , and 4 ) this woulddemon - strate to scientists , with data , that softwarehas a role in the software . ( 这 将 有利于 科学 家 , 利用 数据 , 软件 在 社区 中 发挥 作用 )科学 FIC纪录(托马斯et阿尔 , 2021).所有软件均不支持PyCharm(Annex et al.,2018).我们称之为“社区内部的交流”(We. G.,OWVER,OW—ious communications within the community)。在tele—cons,在双年度会议和PyHC相关研讨会上,我们鼓励使用数字对象识别器(DOI)的软件作为整个版本。这将鼓励更多的科学家将其工作转移到FOSS,作为DOI提供了一种在论文中被引用的软件开发位置。2013 第 十 届 中国 最 佳 实践 (Nielsen&史密斯 , 2014).尼康 D700 单反 套机 (欧洲 核 研究 组织 ( European Organization for Nuclear Research )&OpenAIRE , 2013 年) , 则 实数 a 等于 (哈登 ,et al. 2021 A 号( 1 ) Plasma (PlasmaPy 社区et al. ,2018( 1 ) 求 cos (张 学 良 et al. 2021( 1 ) sin(Morning et al. ,2021例如 : sin (Mumford et al. ,2021( 1 ) x2 = (Ryan et al. , 2021例如 , Python(女巫SDC 的et al. ,2021 1 , 则 a1 = (Stoneback etal. , 2021 ) . It should be noted that most of the corepackages(需要注意的是,大多数核心软件包都需要注意)10、Are you there on a great data data.(Kurtz etal.,2000他们 在 那里 与 他们 的 Zenodo DOI 列出 。原 书 名 : The Gifts Source Library ( Dumblr et al. ,2013).我们 的 目标 是 成为 一 个 对 天文 学家 和 天体 物理 学家 感 兴趣 的 源 代码 的 免费 在线 注册处 , 包括 太阳 系 天文 学家 , 以及 已经 使用 的 代码 列表 。在J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx7research that has appeared in,or been submitted to,同行的 研 究 Reviewed Publications 。 A simple next step tobetter adver - these DOIs , would be the creation of a ' 'references 一 个 简单 的 下一步 , 以 更 好 的 处理 - 这些 DOIs , 会 是 创建 一 个 ' 参考 文献”page on thePyHC 的 相关 文章Website .Burrell et al. ( 2018 )合作 是 对 另 一 个 人 的 工作的 道德 建设 。Thatis , 项目 需要 确保 它们 在 正常情况 下 工作 并 引用 其他 软件 开发 位置 . 10、Python标准化入门教程(Annex et al.,2018). To help makecollabora—tion opportunities easier to discover , thePyHC website has a listing of all PyHC projects under itsprojects page. 为 了 帮 助 建 立 博 客 —tion opportunitieseasier to discover ,the PyHC website has a listing of allPyHC projects under its projects page. PyHC网站列出了所有PyHC项目,其项目页面.这些其他的太阳物理学开发人员要找到他们可以贡献,杠杆和引用的现有项目。PyHC项目提供了很多机会提前进行软件开发,并在电信和双向会议上进行。有一种方法是越来越受欢迎的促进合作的网站是发表引用PyHC软件DOI和其他相关出版物的出版论文。本课程仅在PyHC项目创建软件DOIs(such as those indicated above)或在期刊上发布 时 才 可 能 。 Weigel et al. , 2021 B 号 ( 1 ) 求 cos(Stoneback et al.,2018)).一个更好的解决方案是为这些论文成为Collabora—tive软件工具文件。一个例子,这将是一个可执行的文件。波兹南(2021)这是在写作过程中的一张纸;希望这将是那个大自然的许多出版物的开始。出版 社 应该 是included在the未来PyHC ' 参考 文献”页 。2.3.4. 最 佳 实践 和RIGOR许多科学家没有纯粹的软件工程背景,但RatherLearn a Programming Language on their own in order tocarry out research.(Rather学会一门编程语言,要靠自己的双手开展研究。提供指导—机会给科学家Burrell etal.(2018)指出了所有最佳实践,科学家应该考虑开发软件。许多这些要求和/或建议使用PyHC标准,包括包装规格—广告,操作系统支持,版本控制,编码风格(例如,采用PEP 8)(罗文et al.,2013文档 ( asrelates to docstrings and high-level documentation ) 和Python 版本 使用 。Python文档中的字符串是用于文档中的Python模块、类、函数或方法的字符串,因此程序员可以了解它不需要阅读implemen—tation的细节。因此,它是一种自动生成在线(HTML)文档的常见做法。标准 提供 了 关于 依赖 使用 的 最 佳 实践 的 建议 , 避免 代码 重复 ( 如 许多 可能 的 方式 ) ,而software Releases(Annex et阿尔 , 2018).项目“RIGOR””2013年04月26日@下午12时40分i ==Burns et al.,2018).由于PyHC标准的开放开发—所有代码公开可用。任何Pull request made is open to all inthe community to review and make comments.开放给社区中的所有人进行评论和发表评论。PEERReviewing IS不是required 需要两 个be a 有效 地with PyHC ,J. 巴纳姆 和阿尔Advances在space研究 Research xxx( xxx )xxx8但这是鼓励。PyHC标准规定了软件包必须实现单元测试 , whileencouragingsystemandaccep—tancetesting , as well as automated testing , when possible(当可能时,PyHC标准规定了自动测试)。Annex etal.,2018). Although a mention of code coverage 是 一个 代码 覆盖 范围 的 清单included ,A A规格 FITCpercentage 百分比IS不是包括 在内 。In order to inform users on how a PyHC package 信息mea-sures -up the PyHC标准 ,PyHC执行 的A Aage ' grading system 年龄 分级 系统”。To become aPyHC , projects have to grade themselves against thePyHC 成为 一 个 高效 的 包 , 项目 必须 对 PyHC进行 分级Standards 标准而show that Their softwareeither 的meets all 一起the标准 ,或are积极WorkingTowards会 见 你 。 the self-assigned 自己package”Grade 。”for PyHC Dards - Dards are displayed 显示on the PyHC Websites 的“ 项目 ”首页 AS A A Ttra Clight系统for six Grouping 的of the PyHC stan - dards( 社区 , 文档 , 测试 , 软件 成熟 度 )Python 3使用 ,而implementation 执行of A A FOSS license ;看到https://heliopython.org/projects/对于 a graphi-cal的 Presentation 介 绍 of These 这 些 Grouping ) 。Green Indicates that a package meets Requirements forA A standard Grouping , Yel-Low - 低 means A Apackage meets some 一些of the需求 ,红色 意味 着一 个 包装 很少 或 没有 要求 。当前 , 不 满足 所有 PyHC 标准 的 软件 包 未 被 删除PyHC 的3. 先进 的 PyHCE Orts 地点识别常用Helio—Python物理包的初始工作,使太阳物理和空间天气社区的关键成员,组织社区活动以帮助社区保持重要变化的前沿,更新等,作为识别合作,整合和潜在新项目的潜力领域,情况良好。Thecommunity created a centralized location ( the PyHCwebsite ) under which infor - mation about all of theabove can be found. 为了 继续 作为 一 个 社区 , 同时 , 仍 有 改进 的 地区 。consider 。2020 年 01 月 21 日@下午 12 时 28 分@上午 11 时21 分@上午 12 时 22 分@上午 12 时 22 分@上午 11 时22 分 @ 上 午12 时21 分 @ 上 午12 时21 分(https://iswat-cospar.org/virtual-meeting-series_O2) ,a PyHC 集成 战略 ( IS ) 研讨 会 将 于 8 月 2021 开展 。ISWAT研讨会由PyHC社区的关键成员组成, 如仅限邀请,作为封闭相关社区的关键发现。研讨会允许组织者和
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