FM-Track v1:三维细胞力学追踪分析软件
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更新于2025-01-16
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"FM-Track v1 是一款用于在三维环境中研究细胞力学的标记跟踪软件,由Emma Lejeune等人开发。该软件专注于追踪并量化细胞附近嵌入在顺应性合成或生物凝胶中的基准标记的变形,以揭示细胞在3D空间中的力学行为。FM-Track提供了一个集成的平台,包括图像预处理、基准标记跟踪、后处理和可视化功能,旨在帮助研究人员更准确地提取细胞在透明顺应性凝胶系统中的局部3D收缩信息。该软件基于MIT许可证开源,其最新版本v1的代码和存储库链接可以在GitHub上找到,且支持Python编程语言和相关库如py-earth、scikit-learn、pyvista。"
在细胞生物学和力学研究领域,FM-Track的出现具有重要意义。当前,跟踪三维环境中的基准标记并量化其位移的方法存在特殊性和复杂性,可能导致不一致的结果。FM-Track的出现解决了这个问题,提供了一种紧凑、易实现且可靠的解决方案。它允许研究人员对细胞的局部力学特性进行详细分析,这对于理解细胞在复杂生物环境中的作用至关重要,特别是在细胞迁移、分裂、组织形成等生物学过程中。
此外,FM-Track软件的开源性质促进了科学研究的透明度和协作。通过提供开发人员文档和邮箱支持,研究人员可以轻松访问和改进代码,适应不同的实验需求,进一步推动了细胞力学研究的技术进步。MIT许可证确保了代码的自由使用、复制和修改,鼓励了学术界的创新和共享。
在实际应用中,FM-Track可用于各种实验设置,比如牵引力显微镜(Traction Force Microscopy)实验,这种技术用于测量细胞对基底施加的力。通过FM-Track,可以精确地跟踪细胞周围微小的标记点,进而计算出细胞的力学行为。这在研究细胞与基质相互作用、疾病状态下的细胞力学变化等方面具有极大的价值。
FM-Track v1是一款强大的工具,它简化了三维细胞力学的测量过程,提高了数据的可靠性,同时促进了科研社区的开放合作,对于推进细胞力学和机械生物学领域的研究具有深远的影响。
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2021-10-11 上传
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