# basic model model_basic <- nlme(wt ~ a(1+b*exp(-k*t))^m, data=df_phen_group, fixed=a+b+k+m ~ 1, random=a+k ~ 1, start=c(a=300,b=4,k=0.05,m=70))应该怎么改
时间: 2023-12-15 12:05:32 浏览: 81
11-27-model.rar_11-27-model_混合效应模型_混合模型建立 R
这段代码使用`nlme`函数拟合了一个非线性模型,其中`wt`是因变量,`a`、`b`、`k`、`m`是模型参数,`t`是自变量。如果您想修改该模型,可以根据需要更改参数、拟合方法等。
以下是一些可能的修改示例:
1. 更改因变量:将`wt`替换为其他名称或其他变量。
2. 更改自变量:将`t`替换为其他名称或其他变量。
3. 更改模型形式:根据需要更改模型的函数形式,例如将`a(1+b*exp(-k*t))^m`替换为其他函数。
4. 更改参数:可以根据需要更改初始参数值、固定参数、随机效应等。
下面是一些可能的修改示例代码:
1. 如果您想将因变量`wt`替换为其他变量`y`,可以将代码修改为:
```
# basic model with y as response variable
model_basic <- nlme(y ~ a(1+b*exp(-k*t))^m,
data=df_phen_group,
fixed=a+b+k+m ~ 1,
random=a+k ~ 1,
start=c(a=300,b=4,k=0.05,m=70))
```
2. 如果您想将自变量`t`替换为其他变量`x`,可以将代码修改为:
```
# basic model with x as predictor variable
model_basic <- nlme(wt ~ a(1+b*exp(-k*x))^m,
data=df_phen_group,
fixed=a+b+k+m ~ 1,
random=a+k ~ 1,
start=c(a=300,b=4,k=0.05,m=70))
```
3. 如果您想将模型函数修改为其他形式,例如`a*exp(b*t)+c`,可以将代码修改为:
```
# modified model with a*exp(b*t)+c as model function
model_modified <- nlme(wt ~ a*exp(b*t)+c,
data=df_phen_group,
fixed=a+b+c ~ 1,
random=a ~ 1,
start=c(a=300,b=-0.05,c=70))
```
4. 如果您想修改参数,例如将初始参数值修改为`a=500,b=2,k=0.01,m=50`,可以将代码修改为:
```
# modified model with different starting values
model_modified <- nlme(wt ~ a(1+b*exp(-k*t))^m,
data=df_phen_group,
fixed=a+b+k+m ~ 1,
random=a+k ~ 1,
start=c(a=500,b=2,k=0.01,m=50))
```
注意,以上示例代码仅供参考,具体修改应根据您的实际需求进行。
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