> # basic model > model_basic <- nlme(wt ~ a(1+b*exp(-k*t))^m, + data=df_phen_group, + fixed=a+b+k+m ~ 1, + random=a+k ~ 1, + start=c(20, 10, 0.03, 0.5)) Error in a(1 + b * exp(-k * t)) : could not find function "a"
时间: 2024-01-20 20:02:06 浏览: 218
11-27-model.rar_11-27-model_混合效应模型_混合模型建立 R
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在这段代码中,a(1+b*exp(-k*t))^m 并不是一个合法的R表达式,因此R会报错。如果你想使用幂函数的形式来拟合生长曲线,可以使用以下代码:
```
model_basic <- nlme(wt ~ a * (1 + b * exp(-k * t))^m,
data=df_phen_group,
fixed=a+b+k+m ~ 1,
random=a+k ~ 1,
start=c(20, 10, 0.03, 0.5))
```
在这里,我们将幂函数的形式改为了a*(1+b*exp(-k*t))^m的形式,并且在拟合时需要提供一个初始值m。这样就可以使用nlme函数来拟合基本模型了。
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