model <- gam(Y ~ s(X1)+s(X2)+s(X3)+s(X4), data = dat, family = gaussian) summary(model) cv_model <- cv.gam(model, K = 10) # K为交叉验证折数 summary(cv_model) # 预测值 library(ggeffects) pred <- ggpredict(model, terms = c("X1", "X2", "X3", "X4")) # 图像处理 # 绘制GAM图,可以使用ggplot2包: merged_list <- Reduce(function(x, y) c(x, y), list("X1", "X2", "X3", "X4")) gg.gam <- ggplot(pred, aes(x = x, y = predicted, color = predicted)) + geom_point(size = 3) + labs(x = "Predictor", y = "Output") + ggtitle("Output vs Predictor") + xlab("Predictor") + ylab("Output") + scale_color_gradient(low = "blue", high = "red", name = "Output") print(gg.gam)解释下想,y的关系
时间: 2024-04-28 21:21:00 浏览: 170
这段代码利用GAM模型和交叉验证来建立预测变量(X1、X2、X3和X4)与响应变量(Y)之间的关系,并绘制了变量的预测值与实际值之间的关系图。
GAM模型中,使用了四个自变量(X1、X2、X3和X4)的平滑项来拟合响应变量Y。交叉验证是一种评估模型预测能力的方法,它将数据分成K个子集,每个子集轮流作为测试集,其余的子集作为训练集,重复K次。这个过程可以帮助我们评估模型的稳定性和准确性。
在使用ggeffects包绘制预测值与实际值之间的关系图时,使用了ggplot2包。图中每个点代表一个观测值,颜色表示预测值的大小,蓝色表示预测值较小,红色表示预测值较大。图中可以看出,随着X1、X2、X3和X4的值增加,Y的预测值会增加或减少,这表明X1、X2、X3和X4与Y之间存在一些关系。但具体的关系需要根据数据的实际情况来分析。
总的来说,这段代码主要用于建立预测变量与响应变量之间的关系,并通过绘制预测值与实际值之间的关系图来可视化这种关系。
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dat =as.data.frame(data1) colnames(dat) = c('X1','X2','X3','X4','Y') mod_gam <- gam(Y ~ s(X1)+s(X2)+s(X3)+s(X4),data=dat) summary(mod_gam)
这段代码使用了R语言中的mgcv包,将data1数据框转换为dat数据框,并给每个变量命名。然后,使用gam函数拟合了一个基于平滑项的广义可加模型(Generalized Additive Model, GAM),其中响应变量Y与四个自变量X1、X2、X3、X4之间的关系都用平滑项来拟合。最后,使用summary函数输出了模型的统计结果,包括每个平滑项的edf、F值和p值,以及模型的R-squared(adj)和Deviance explained等评估指标。
model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian) summary(model)如何对sp进行修改
在R语言中,GAM模型中的参数主要包括平滑函数的度数、平滑函数的类型和正则化参数等。其中,平滑函数的类型和正则化参数可以通过修改参数sp来进行调整。参数sp控制了平滑函数的光滑程度,值越小表示平滑函数越光滑,值越大表示平滑函数越不光滑。
如果你已经拟合了一个GAM模型,并且想要修改其中某个变量的sp参数,可以通过以下步骤进行修改:
1. 找到要修改的变量对应的平滑函数;
2. 修改该平滑函数的sp参数;
3. 更新GAM模型。
例如,以下代码展示了如何修改第一个自变量X1对应的平滑函数的sp参数。
```R
# 原始模型
model <- gam(Y ~ s(X1, k = 5, sp = 0.5) + s(X2, k = 5, sp = 0.3) + s(X3, k = 5, sp = 0.2) + s(X4, k = 5, sp = 0.4) + s(X5, k = 5, sp = 0.3) + s(X6, k = 5, sp = 0.2) + s(X7, k = 5, sp = 0.4), data = dat, family = gaussian)
# 修改X1对应的平滑函数的sp参数为0.7
model$smooth[[1]]$sp <- 0.7
# 更新GAM模型
model <- update(model)
```
以上代码中,首先定义了一个GAM模型,并且指定了每个变量对应的平滑函数和对应的sp参数。然后,通过修改第一个变量X1对应的平滑函数的sp参数为0.7,再通过update函数更新GAM模型。
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