from rdkit import Chem # 创建反应物 rxn_mol = 'C6H12O6' # 创建SMILES表示 smiles = 'CC=C(C2H3)OC(=O)C(=O)C(=O)C(=O)CC' # 创建SMILES表示 smiles_rxn = SMILES.from_string(smiles) # 创建反应物,并将其打散为液态 rxn_reactants = 'CC=C(=O)CC(=O)C(=O)C' rxn_reactants_mol = ReactantsMolFromSmiles('C6H12O6') rxn_reactants_mol.setReactantsForImage('C6H12O6') rxn_reactants_mol.setProductToImage('C6H12O6') rxn_reactants_mol.setSmarts(smarts) rxn_reactants_mol.create() # 打散反应物,并将其打散为液态。 rxn_reactants.setReactantsForImage('C6H12O6') rxn_reactants.setProductToImage('C6H12O6') rxn_reactants.setSmartsSmarts('H2O') rxn_reactants.create()
时间: 2024-04-10 21:27:49 浏览: 168
在您的代码中,有一些小错误。下面是修正后的代码:
```python
from rdkit import Chem
# 创建反应物
rxn_mol = 'C6H12O6'
# 创建SMILES表示
smiles = 'CC=C(C2H3)OC(=O)C(=O)C(=O)C(=O)CC'
# 创建反应物的SMILES表示
reactant_smiles = 'CC=C(=O)CC(=O)C(=O)C'
# 创建反应物的RDKit分子对象
rxn_reactants_mol = Chem.MolFromSmiles(reactant_smiles)
# 创建反应物和产物的RDKit分子对象
rxn_reactants = Chem.MolFromSmiles(rxn_mol)
rxn_product = Chem.MolFromSmiles(smiles)
# 将反应物和产物的RDKit分子对象转换为SMILES字符串
rxn_reactants_smiles = Chem.MolToSmiles(rxn_reactants)
rxn_product_smiles = Chem.MolToSmiles(rxn_product)
# 打印生成的反应物和产物的SMILES字符串
print('生成的反应物的SMILES表示:', rxn_reactants_smiles)
print('生成的产物的SMILES表示:', rxn_product_smiles)
```
在上述代码中,我们使用`rdkit.Chem`模块导入了RDKit库,并使用`Chem.MolFromSmiles()`函数将反应物和产物的SMILES字符串转换为RDKit的分子对象。
然后,使用`Chem.MolToSmiles()`函数将分子对象转换回SMILES字符串,以便打印出生成的反应物和产物对象的字符串。
请确保已正确安装RDKit库,并在代码中导入了所需的模块。
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