# coding=utf-8 #加载化学库 from rdkit import Chem from rdkit.Chem import Draw from rdkit.Chem import AllChem import pandas as pd # 读取 CSV 文件 data = pd.read_csv('dataSetA.csv') # 提取 rxn_smiles 列 rxn_smiles = data['rxn_Smiles'] # 遍历每个 rxn_smiles 字符串并打印 for smi in rxn_smiles: print(smi) rxn = Chem.AllChem.ReactionFromSmarts(smi) if rxn is not None: # 绘制反应结构 img = Draw.ReactionToImage(rxn) img.show() else: print("Failed to parse rxn_smiles.")最后要保存成图片要怎么写
时间: 2024-04-17 16:25:05 浏览: 20
要将绘制的反应结构保存为图片,您可以使用`img.save`方法来保存图片。以下是修改后的代码示例:
```python
# 遍历每个 rxn_smiles 字符串并保存图片
for i, smi in enumerate(rxn_smiles):
print(smi)
rxn = Chem.AllChem.ReactionFromSmarts(smi)
if rxn is not None:
# 绘制反应结构
img = Draw.ReactionToImage(rxn)
img.save(f'reaction_{i}.png')
else:
print("Failed to parse rxn_smiles.")
```
在上述代码中,添加了一个`enumerate`函数来获得循环的索引值,以便在保存文件时为每个反应结构创建唯一的文件名。通过在`img.save`方法中传递文件名参数,可以将绘制的反应结构保存为PNG文件。
请注意,将文件名设置为`reaction_{i}.png`会根据循环的索引值创建唯一的文件名。如果您希望使用其他文件名格式,请根据需要进行修改。确保在适当的位置进行替换,以指定您希望保存图像的文件路径和文件名。
相关问题
# coding=utf-8 和 # coding: utf-8有什么区别
两者的作用是相同的,都是用来指定Python源文件的编码格式为UTF-8。但是,它们的语法有所不同:
- `# coding=utf-8` 使用了等号,这种写法在Python 2.x中是不支持的,只有在Python 3.x中才能使用。
- `# coding: utf-8` 使用了冒号,这种写法在Python 2.x和Python 3.x中都是支持的。
在Python 2.x中,如果你想指定文件编码格式为UTF-8,应该使用第二种写法,即 `# coding: utf-8`。在Python 3.x中,两种写法都可以使用,但是推荐使用第一种写法,即 `# coding=utf-8`。
#coding=utf-8 from requests_html import HTMLSession session = HTMLSession() import time import csv import os 什么意思
这段代码的作用是导入所需的模块和库,以及设置Python源文件的编码格式为UTF-8。
- `from requests_html import HTMLSession` 导入了名为`HTMLSession`的类,该类可以用于进行HTTP请求和解析HTML内容。
- `session = HTMLSession()` 创建了一个`HTMLSession`的实例对象,用于发送HTTP请求和处理响应。
- `import time` 导入了Python内置的`time`模块,用于进行时间相关的操作,如暂停程序执行。
- `import csv` 导入了Python内置的`csv`模块,用于读写CSV文件。
- `import os` 导入了Python内置的`os`模块,用于与操作系统进行交互,如文件操作和路径操作。
最后一行 `#coding=utf-8` 是一个注释,它表示该源文件的编码格式是UTF-8。这是一种常见的编码格式,用于支持多种语言和字符集。在Python 3中,通常不需要显式地声明编码格式,因为默认编码格式就是UTF-8。但是在旧版本的Python或特定环境中,可能需要添加这样的注释来确保正确的编码处理。