R语言基于richards树高-直径模型sensitivity包全局敏感性分析,绘制出相关的图表
时间: 2024-02-06 21:03:14 浏览: 78
好的,关于您的问题,我会尽力回答。下面是基于richards树高-直径模型进行全局敏感性分析的一般步骤,供您参考。
1. 安装sensitivity包并加载:
```R
install.packages("sensitivity") # 安装sensitivity包
library(sensitivity) # 加载sensitivity包
```
2. 定义richards树高-直径模型:
```R
richards <- function(d, h, a, b, c, x){
# d: 直径
# h: 树高
# a, b, c: 模型参数
# x: 自变量
# 返回值:因变量
y <- a + (b - a) / (1 + exp(c - d))
y <- y * (x / (1 + x / h))^(-1 / c)
return(y)
}
```
3. 定义参数范围和分布:
```R
# d: 直径,均匀分布
d_min <- 10
d_max <- 50
d_dist <- "unif"
# h: 树高,均匀分布
h_min <- 5
h_max <- 30
h_dist <- "unif"
# a, b, c: 模型参数,正态分布
a_mean <- 0
a_sd <- 1
a_dist <- "norm"
b_mean <- 100
b_sd <- 10
b_dist <- "norm"
c_mean <- 3
c_sd <- 0.5
c_dist <- "norm"
# x: 自变量,常数
x <- 1
```
4. 进行全局敏感性分析:
```R
X <- list(d = list(distribution = d_dist, min = d_min, max = d_max),
h = list(distribution = h_dist, min = h_min, max = h_max),
a = list(distribution = a_dist, mean = a_mean, sd = a_sd),
b = list(distribution = b_dist, mean = b_mean, sd = b_sd),
c = list(distribution = c_dist, mean = c_mean, sd = c_sd))
Y <- data.frame(matrix(0, ncol = 1, nrow = 1000))
names(Y) <- "Y"
sa <- sobolSalt(X, richards, Y, nboot = 100, parallel = TRUE)
```
其中,X是参数范围和分布的列表,Y是模型输出的结果,richards是定义的richards树高-直径模型函数,nboot是bootstrap的次数,parallel表示是否进行并行计算。
5. 绘制图表:
根据分析结果,可以绘制出不同参数的Sobol指数,以及总敏感性指数和一阶敏感性指数的条形图和蜘蛛图,用于直观地展示各参数对模型输出的影响程度。
具体的绘图方法可以根据自己的需要进行选择,可以使用R语言中的ggplot2、plotly等绘图工具包,或者使用其他绘图软件进行绘制。
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