如果是三层并且用mongoTemplate来进行深层修改

对于三层的数据结构，使用MongoTemplate进行深层修改可以通过以下步骤实现：

1. 获取需要进行修改的文档对象。
2. 使用MongoTemplate的updateMulti方法来实现针对多个文档的更新操作。
3. 在updateMulti方法中使用Query和Update对象来指定需要更新的文档和更新操作。
4. 在Update对象中使用set方法来指定需要更新的字段和对应的值。

下面是一个简单的代码示例：

//获取需要进行修改的文档对象
ThirdLayerDocument thirdLayerDocument = mongoTemplate
    .findOne(Query.query(Criteria.where("id").is("123")), ThirdLayerDocument.class);

//使用MongoTemplate的updateMulti方法来实现针对多个文档的更新操作
Update update = new Update();
update.set("secondLayerDocumentList.$.fieldName", "new value");

mongoTemplate.updateMulti(
    Query.query(Criteria.where("id").is("123")
        .and("secondLayerDocumentList.thirdLayerDocumentList.id").is("456")
    ),
    update,
    ThirdLayerDocument.class
);

在上述示例中，我们首先获取了需要进行修改的文档对象。然后，我们使用MongoTemplate的updateMulti方法来实现针对多个文档的更新操作。在updateMulti方法中，我们使用Query和Update对象来指定需要更新的文档和更新操作。在Update对象中，我们使用set方法来指定需要更新的字段和对应的值。最后，我们调用MongoTemplate的updateMulti方法来执行更新操作。