nhanes 体力活动时间计算 R代码
时间: 2024-01-12 22:05:23 浏览: 1132
以下是计算nhanes体力活动时间的R代码:
```R
library(nhanesA)
library(dplyr)
# 加载数据
data(nhanes_2015_2016)
# 计算体力活动时间
nhanes_2015_2016 %>%
# 选择感兴趣的变量
select(SEQN, PAQ605, PAD615, PAQ620) %>%
# 重命名变量
rename(id = SEQN, vigorous = PAQ605, moderate = PAD615, walking = PAQ620) %>%
# 转换为长格式
pivot_longer(cols = c(vigorous, moderate, walking),
names_to = "activity",
values_to = "time") %>%
# 计算每个人的总体力活动时间
group_by(id) %>%
summarize(total_time = sum(time, na.rm = TRUE)) %>%
# 查看结果
head()
```
代码中使用了nhanesA包,该包提供了nhanes数据集的便捷访问。首先加载数据,然后选择感兴趣的变量并重命名它们。接下来,将数据转换为长格式,以便能够在单个列中计算所有体力活动时间。然后,按个人对数据进行分组,并计算每个人的总体力活动时间。最后,使用head函数查看前几行结果。
相关问题
nhanes 体力活动分组
NHANES(National Health and Nutrition Examination Survey)是美国国家卫生和营养调查的缩写,是一项全国性的健康和营养状况调查。NHANES调查中,体力活动分组(PAQ)是评估个体身体活动水平的一个工具,根据个体参与的体力活动类型、强度和时长,将个体分为以下四个级别:
1. 低水平:没有或极少参与中等或高强度的体力活动,例如长时间坐着看电视或阅读。
2. 轻度活动水平:参与中等或高强度的体力活动小于150分钟/周,例如散步或轻度的园艺活动。
3. 中度活动水平:参与中等或高强度的体力活动150-300分钟/周,例如快步走、跑步或游泳。
4. 高活动水平:参与中等或高强度的体力活动超过300分钟/周,例如慢跑、游泳或重量训练等。
NHANES做RCS的R语言代码
为了使用R语言对NHANES数据进行RCS(Restricted Cubic Spline)分析,你可以使用rms(Regression Modeling Strategies)软件包中的rcs函数。下面是一个示例代码:
```R
# 安装和加载rms软件包
install.packages("rms")
library(rms)
# 读取NHANES数据
data(NHANES)
# 进行RCS分析
fit <- lrm(bmi ~ rcs(age, 3), data = NHANES)
summary(fit)
```
在上面的代码中,我们首先安装并加载了rms软件包。然后,我们使用`data`函数从rms软件包中加载NHANES数据集。接下来,我们使用`lrm`函数创建一个逻辑回归模型,其中`bmi`是因变量,`age`是自变量,并使用`rcs`函数对`age`变量进行RCS转换。最后,我们使用`summary`函数来查看模型的摘要信息。
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