python读取hdf文件
时间: 2023-09-12 15:03:43 浏览: 161
在 Python 中,可以使用 `h5py` 和 `pytables` 两个库读取 HDF5 文件。以下是使用 `h5py` 读取 HDF5 文件的示例代码:
```python
import h5py
# 打开 HDF5 文件
with h5py.File('example.h5', 'r') as f:
# 查看文件中的数据集
print(list(f.keys()))
# 读取数据集
dataset = f['dataset_name'][()]
# 打印数据集
print(dataset)
```
其中,`example.h5` 是 HDF5 文件的文件名,`dataset_name` 是 HDF5 文件中数据集的名称。在 `with` 语句块中打开文件后,可以使用 `keys()` 方法查看文件中的所有数据集名称,使用索引方式获取指定名称的数据集,最后使用 `()` 运算符读取数据集的值。
相关问题
python 读取hdf文件
要在Python中读取HDF文件,可以使用不同的包,如pyhdf和PyTables。对于HDF4及以下版本,可以使用pyhdf包进行读取。首先,需要导入相应的包:
```python
from __future__ import division
from pyhdf.SD import SD, SDC
import pprint
```
然后,可以通过指定HDF文件的路径来打开文件对象:
```python
hdf_name = 'patmpsx_n18.levels.hdf'
print('file found {}'.format(hdf_name)) # 输出数据文件的名字以及所处的文件夹
hdf_obj = SD(hdf_name)
print(hdf_obj.info())
```
另一种读取HDF文件的方法是使用PyTables包。首先,需要导入相应的包和模块:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
from tables import *
```
然后,可以打开HDF文件并遍历其中的组和节点:
```python
f = "D:\Download\D202107180081468319/FY3C_MERSI_GBAL_L1_20150529_0210_0250M_MS.HDF"
h5file = open_file(f, 'r')
for group in h5file.walk_groups():
print(group)
for node in h5file:
print(node)
```
如果想要显示HDF文件中的数据,可以使用Matplotlib绘制图像:
```python
dt = h5file.root.Data.EV_250_RefSB_b3
plt.contour(dt)
plt.show()
```
总结来说,Python读取HDF文件的方法有多种选择,可以根据具体的需求选择适合的包和方法。
python读取HDF文件
Python可以使用h5py和netCDF4库来读取HDF文件。使用h5py库,可以使用以下代码将数据写入HDF5文件:
```python
import h5py
import numpy as np
imgData = np.zeros((30,3,128,256))
f = h5py.File('HDF5_FILE.h5','w')
f['data'] = imgData
f['labels'] = range(100)
f.close()
```
使用以下代码从HDF5文件中读取数据:
```python
import h5py
f = h5py.File('HDF5_FILE.h5','r')
a = f['data'][:]
f.close()
```
使用netCDF4库,可以使用以下代码从HDF4或HDF5文件中读取数据:
```python
import netCDF4 as nc
f = nc.Dataset('1.hdf')
vars = f.variables
for var in vars:
print(var)
data = f['Optical_Depth_047'][:]
```
如果需要读取HDF4文件,可以使用pyhdf库:
```python
from pyhdf.SD import SD
f = SD('1.hdf')
print (f)
print(f.info())
data_dic = f.datasets()
for idx,sds in enumerate(data_dic.keys()):
print (idx,sds)
od01 = f.select('Optical_Depth_047')[:]
od02 = f.select('Optical_Depth_047').get()
```
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