java 读取 HDF5

在Java中，可以使用Hadoop的HDF5 API或者第三方库如Apache Tika、HDF5-JNI或者HDF5 Java bindings来读取HDF5文件。以下是基本步骤：

1. **添加依赖**：如果你选择的是HDF5-JNI，需要将HDF5的JNI库添加到项目的构建路径中。对于Apache Tika，则是通过Maven或Gradle管理依赖。

<!-- Maven -->
<dependency>
    <groupId>org.apache.tika</groupId>
    <artifactId>tika-parsers</artifactId>
    <version>最新版本号</version>
</dependency>

<!-- Gradle -->
implementation 'org.apache.tika:tika-parsers:最新版本号'

2. **加载数据**：使用Tika，你可以创建`ContentDetector`和`Parser`实例来解析HDF5文件内容。

import org.apache.tika.Tika;
import org.apache.tika.mime.MediaType;
import org.apache.tika.parser.ParseContext;
import org.apache.tika.parser.Parser;

public class HDF5Reader {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        Tika tika = new Tika();
        try (InputStream stream = new FileInputStream("your_hdf5_file.h5")) {
            ParseContext parseContext = new ParseContext();
            String content = tika.parse(stream, MediaType.APPLICATION_HDF5, parseContext).toString();
            System.out.println(content);
        }
    }
}

3. **HDF5-JNI或HDF5 Java Bindings**: 如果你想直接操作HDF5文件，那么你需要使用HDF5的原生API。例如，HDF5-JNI库提供Java接口来访问HDF5文件。

import hdf.hdf5.H5;
import hdf.hdf5.H5F;
import hdf.hdf5.H5I;

public class Hdf5NativeReader {
    public static void main(String[] args) {
        H5.open(new File("your_hdf5_file.h5"), H5F.ACC_RDONLY, H5P.create(H5P.FILE_ACCESS));
        // 使用H5 API读取数据...
        H5.close();
    }
}