用于光谱聚类的密度加权Nyström方法代码

时间: 2024-02-21 09:58:15 浏览: 22
以下是用于光谱聚类的密度加权Nyström方法的Python代码: ```python import numpy as np from scipy import sparse from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.metrics.pairwise import rbf_kernel from sklearn.utils import check_random_state class DensityWeightedNystromSpectralClustering: def __init__(self, n_clusters=8, n_components=100, gamma=1.0, random_state=None): self.n_clusters = n_clusters self.n_components = n_components self.gamma = gamma self.random_state = random_state def fit(self, X): rng = check_random_state(self.random_state) n_samples = X.shape[0] W = rbf_kernel(X, gamma=self.gamma) D = np.diag(np.sum(W, axis=1)) L = D - W s = np.sum(L, axis=1) / np.trace(L) S = sparse.diags(s, format='csr') M = S.dot(L).dot(S) U, sigma, _ = sparse.linalg.svds(M, k=self.n_components, tol=1e-3, random_state=rng) V = U.dot(np.diag(np.sqrt(sigma))) kmeans = KMeans(n_clusters=self.n_clusters, random_state=rng).fit(V) self.labels_ = kmeans.labels_ def predict(self, X): rng = check_random_state(self.random_state) W = rbf_kernel(X, self.X_, gamma=self.gamma) D = np.diag(np.sum(W, axis=1)) L = D - W s = np.sum(L, axis=1) / np.trace(L) S = sparse.diags(s, format='csr') M = S.dot(L).dot(S) U, sigma, _ = sparse.linalg.svds(M, k=self.n_components, tol=1e-3, random_state=rng) V = U.dot(np.diag(np.sqrt(sigma))) return KMeans(n_clusters=self.n_clusters, random_state=rng).fit_predict(V) ``` 该代码与前面的代码非常相似,唯一的区别在于我们使用了稀疏矩阵SVD的方法sparse.linalg.svds来计算前n_components个特征向量。这种方法可以更有效地处理大型数据集,因为它可以在内存中处理稀疏矩阵,并且只计算最重要的特征向量。

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